Análisis molecular para identificar cánceres específicos

Se ha descrito un método que identifica rearreglos causantes de cáncer de material genético llamados traslocaciones genéticas, con rapidez, exactitud y economía.

La técnica desarrollada combina la tecnología de microarrays, que puede buscar miles de traslocaciones en una sola prueba, con un anticuerpo novedoso que de usa para detectar la presencia de la traslocación.

Científicos en la Universidad de Utah (Salt Lake City, UT) desarrollaron un método nuevo, llamado detección de traslocaciones con anticuerpos (ADOT), para identificar el sarcoma de Ewing, y evitar los problemas de las técnicas corrientes. La técnica se aplica a muestras de tumores primarios congeladas o en parafina (FFPE). El ácido ribonucleico (ARN) es extraído, seguido por hibridización con microaarays y detección de anticuerpos. Se realizó una reacción en cadena de la polimerasa, con trascripción reversa (RT-PCR) usando el kit iScript SYBR green RT-PCR (Bio-Rad; Hercules, CA, EUA).

El ARN total de las células tumorales o tejidos fue hibridizado en el array. El ARN unido fue detectado con un anticuerpo monoclonal que reconoce dúplex de ARN-ADN en una manera independiente de la secuencia. Muchos tipos de cáncer son el resultado de translocaciones cromosómicas en las células tumorales. Se han descubierto cientos de traslocaciones causantes de cáncer, pero los métodos actuales para su detección tienen deficiencias significativas. Los investigadores fueron capaces de detectar una translocación específica en tres de cuatro muestras FFPE. El método es mucho mejor con muestras de la vida real que las técnicas convencionales actuales. ADOT es capaz de detectar translocaciones conocidas o desconocidas en muestras biológicas, incluidas las más comúnmente encontradas durante el estudio diagnóstico de un paciente. ADOT parece prometedora como una herramienta de descubrimiento para identificar transcritos de fusión en los cánceres, así como una herramienta de diagnóstico para los pacientes con tumores asociados a translocaciones.

Stephen L. Lessnick, MD, PhD, autor principal del estudio, dijo: “Nos estamos moviendo más allá de la edad en que un patólogo mirando a través del microscopio una muestra del tumor, es la mejor manera de diagnosticar el tipo de cáncer. Las pruebas moleculares disponibles en la actualidad son lentas, ineficientes y costosas, y uno de los mayores problemas es que se necesitan muestras de alta calidad de los tumores, no siempre disponibles en el entorno clínico, para hacerlas. Con este método, hay potencial para desarrollar un único array que podría detectar todas las translocaciones conocidas que causan cáncer, al mismo tiempo. En la actualidad, un médico tiene que decidir de antemano qué tipo específico de cáncer poner a prueba”. El estudio fue publicado, en línea, el 15 de marzo de 2012, en la revista European Molecular Biology Organization (EMBO) Molecular Medicine.

Enlaces relacionados:

University of Utah

Bio-Rad