Nuevas soluciones de secuenciación de próxima generación brindan herramienta poderosa para investigación mieloide con flujo de trabajo altamente eficiente

OGT (Oxford, Reino Unido), una empresa del Grupo Sysmex (Kobe, Japón), ha lanzado varias soluciones nuevas para respaldar su creciente cartera de secuenciación de próxima generación (NGS). Estas incluyen el panel SureSeq Myeloid Plus, que ha sido diseñado para detectar aberraciones en genes implicados en una variedad de trastornos mieloides. Además, OGT también ha lanzado un nuevo flujo de trabajo de preparación de bibliotecas mejorado: el OGT Universal NGS Complete Workflow, compatible con sus paneles de NGS de hematología, herencia y enfermedades raras, que reduce significativamente el tiempo de trabajo y se complementa con el software de análisis Interpret NGS actualizado.

El panel SureSeq Myeloid Plus es la incorporación más reciente a la cartera de NGS para hematología de OGT. Habiendo sido meticulosamente diseñado junto con los principales expertos en cáncer, el nuevo panel puede detectar una amplia gama de aberraciones que incluyen SNV, indels, ITD y PTD dentro de 49 genes. Estos genes cubren los asociados con trastornos mieloides, incluida la leucemia mieloide aguda, las neoplasias mieloproliferativas y el síndrome mielodisplásico, entre otros. Gracias a la amplia experiencia de OGT en el diseño de cebos, el panel Myeloid Plus entrega una uniformidad de cobertura sin igual para variantes de baja frecuencia, incluso en regiones ricas en AT/GC difíciles de secuenciar y regiones desafiantes que cubren ITD y PTD, que son variantes somáticas comunes en la leucemia mieloide aguda (LMA), a menudo asociada con un mal pronóstico y una forma agresiva de la enfermedad. El poder del panel Myeloid Plus es un testimonio de los beneficios de la captura de hibridación sobre el enriquecimiento de PCR para niveles inigualables de sensibilidad y uniformidad de cobertura.

Para apoyar a los investigadores que utilizan el panel SureSeq Myeloid Plus y todos los paneles SureSeq de hematología y CytoSure NGS de OGT, se ha desarrollado el nuevo Universal NGS Complete Workflow. Al reducir la cantidad de pasos de limpieza y los requisitos de control de calidad, la preparación de la biblioteca se puede completar en solo cuatro horas y media, con un ahorro del 40 % en el tiempo de manipulación. Al combinar varios pasos e introducir una agrupación de muestras, la complejidad reducida del flujo de trabajo no solo disminuye la posibilidad de error, sino que también ahorra costos y desechos plásticos.

En comparación con el flujo de trabajo anterior de SureSeq, la versión actualizada no requiere costosos equipos de laboratorio adicionales, lo que hace que el proceso sea mucho más fácil de automatizar y, por lo tanto, esté listo para el futuro. Para complementar este flujo de trabajo nuevo y mejorado, el renombrado software Interpret NGS Analysis (V3.5) de OGT se actualizó con mejoras en la interpretación, anotación, visualización e importación de CNV e importación y visualización de datos de muestra. A diferencia de muchos otros proveedores de NGS, OGT proporciona software de NGS complementario con sus paneles de NGS, lo que demuestra el compromiso de la empresa de compartir tecnología y experiencia técnica para apoyar la investigación de NGS en todo el mundo.

"En OGT, somos expertos en ofrecer flujos de trabajo NGS de alta eficiencia con los mejores paneles de genes, software y soluciones de preparación de bibliotecas de su clase", dijo Adrian Smith, director ejecutivo de OGT. “Gracias a nuestra experiencia inigualable en el diseño de cebos y a través de la asociación con los principales expertos en cáncer, hemos desarrollado una poderosa herramienta para la investigación mieloide con un flujo de trabajo altamente eficiente. Esto permite a los investigadores clínicos detectar de forma rápida y segura todas las variantes relevantes en un ensayo simple. NGS es un área clave de experiencia para OGT, y tenemos planes y posibilidades emocionantes para el futuro”.

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