Nuevos sistemas de secuenciación de ADN de próxima generación conviven con sistemas capilares

Más de uno en cuatro secuenciadores pertenecientes a los laboratorios encuestados todavía es un Sanger o un sistema de tipo capilar y casi la mayoría están fabricados por Life Technologies (Carlsbad, CA, EUA).

El informe incluye estadísticas sobre propiedad de modelos, propiedad cruzada por marca, información sobre aplicaciones, planes y propiedad regional. Está basado en una encuesta telefónica a 110 laboratorios llevada a cabo desde abril hasta junio de 2013. La encuesta estaba dirigida a laboratorios factibles de realizar o que consideraran realizar aplicaciones de secuenciación en ámbitos de diagnóstico o ensayos clínicos.

Los sistemas capilares o Sanger utilizan una tecnología más antigua y operan a una capacidad y velocidad mucho menor en comparación con sistemas más nuevos y procesos químicos presentados en los últimos años. Los sistemas capilares más comunes son los Life Tech/ABI 3730xl y el 3730; sumados representan el 60% de los sistemas capilares utilizados en los laboratorios encuestados. El informe sugiere que aquellos sistemas no son requeridos por muchos laboratorios, pero aquellos que los poseen logran mantenerlos en funcionamiento durante muchos años.

“Aunque los sistemas capilares siguen en uso en la mayoría de los laboratorios en la misma medida año tras año, actualmente no se los compra con tanta frecuencia,” dijo Justin Saeks, autor del informe. “Todavía tienen una función en la secuenciación de genes individuales o pocos genes simultáneamente, y también para la validación de resultados de los sistemas NGS.”

El informe explica que se mantiene el interés en el crecimiento de la NGS pero beneficia en forma desproporcionada a una empresa en particular y mantiene su competitividad en el mercado en formas que otros análisis del sector de secuenciación han pasado por alto. Justin Saeks agregó que Life Tech/ABI también se beneficia de la longevidad de sus sistemas capilares porque venden la mayoría de los consumibles utilizados en estos sistemas, mientras que el mercado de consumibles de NGS es más competitivo. Este factor es importante para comprender cuál es la situación competitiva de mercado para los secuenciadores.

Los sistemas capilares se están utilizando como un paso de validación de los procesos de NGS en aplicaciones clínicas. Por ejemplo, cuando un paciente recibe un diagnóstico positivo de NGS, frecuentemente se utilizan los secuenciadores capilares para confirmar dichos resultados. El costo más alto de base se compensa por la mayor calidad de los datos y se mitiga con que sea necesario secuenciar uno o varios de los nuevos genes mutados diagnosticados, con el objeto de validarlos. Esencialmente la secuenciación capilar sigue siendo la prueba de referencia debido a sus prolongados antecedentes de exactitud y rentabilidad para muestras reguladas.

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