Desarrollan análisis estandarizados para cuantificar proteínas humanas

Se han desarrollado mediciones estandarizadas de proteínas a gran escala, que son necesarias para hacer factibles la validación de marcadores biológicos de la enfermedad.

La espectrometría de masas con monitorización múltiple de las reacciones (MRM) fue aplicada con éxito para monitorizar proteínas específicas en muestras biológicas, aumentando la posibilidad de que los ensayos se puedan configurar para medir todas las proteínas humanas.

Los científicos del Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson (Seattle, WA, EUA, www.fhcrc.org) en colaboración con otras intuiciones estudiaron a fondo un método de detección de proteínas que tiene la capacidad de medir, de forma sistemática y confiable, todo el repertorio humano de proteínas, conocido como el proteoma. La técnica MRM puede detectar simultáneamente y con precisión la abundancia de cientos de proteínas en muchas muestras diferentes. Los equipos de investigadores fueron capaces de reproducir las mediciones de 319 proteínas presentes en las células de cáncer de mama humano, mostrando que el método puede ser estandarizado en todos los laboratorios nacionales y más allá de las fronteras internacionales.

Este método permitió la cuantificación altamente específica, precisa, múltiplex, de un mínimo de 170 proteínas en 20 muestras clínicas por instrumento por día; ninguna otra tecnología existente tiene esta capacidad. Debido a que la técnica de espectrometría de masas es dirigida, lo que significa que los científicos pueden sintonizar los instrumentos para buscar un subconjunto específico de las proteínas en las células del cáncer o en otros tipos de muestras, se puede detectar la presencia de proteínas de interés en niveles mucho más bajos en las muestras de sangre minúsculas o biopsias que con una táctica no dirigida.

Amanda Paulovich, MD, la autora principal del estudio, dijo: “Este método tiene el potencial para revolucionar por completo la manera de medir las proteínas humanas. Tener un recurso global para la cuantificación estandarizada de todas las proteínas humanas podría establecer nuevos estándares que, sin duda, aumentarían la reproducibilidad de la investigación preclínica, lo que tendría un impacto dramático en la traducción de nuevos productos terapéuticos y de diagnóstico. En este momento, no se pueden hacer mediciones robustas de la mayoría de las proteínas humanas. Más de 10 años después de que el genoma humano ha sido secuenciado y tenemos el catálogo completo de moléculas tan importantes como proteínas, todavía no podemos estudiar el proteoma humano con cualquier tipo de eficiencia de una manera estandarizada, cuantitativa”. El estudio fue publicado el 8 de diciembre de 2013, en la revista Nature Methods.

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Fred Hutchinson Cancer Research Center