Validan prueba isotérmica de alta eficiencia para el VPH

El virus del papiloma humano (VPH) es una infección viral que se transmite entre las personas a través del contacto de piel a piel. Hay más de 100 variedades de VPH, de las que más de 40 se transmiten por contacto sexual y pueden afectar los genitales, la boca o la garganta.

Algunos tipos de VPH se consideran de alto riesgo porque pueden causar cáncer. Las pruebas de VPH detectan el material genético (ADN o ARN mensajero) del VPH de alto riesgo (VPHar), principalmente para detectar el cáncer de cuello uterino o para determinar si existe un riesgo de cáncer de cuello uterino.

Un gran equipo de científicos internacionales dirigido por el Centro de Cáncer Memorial Sloan Kettering (Nueva York, NY, EUA), realizó una validación analítica de los ensayos de VPH AmpFire Multiplex (AtilaBiosystems, Mountain View, CA, EUA) en muestras de tejido de diagnóstico de cuello uterino/vulva y orofaringe, fijadas en formol e incluidas en parafina (FFPE). El ensayo AmpFire incorpora una amplificación multiplex isotérmica nueva junto con detección fluorescente en tiempo real para detectar y genotipificar 15 genotipos de VPH de alto riesgo (AR).

El desempeño de los ensayos AmpFire en muestras clínicas se evaluó utilizando 214 muestras de FFPE. El equipo internacional también evaluó la prueba Atila AmpFire HPV comparándola con las pruebas estándar de oro, las pruebas Roche Cobas HPV y LinearArray (Risch-Rotkreuz, Suiza). El equipo informó que los límites de detección determinados por los plásmidos clonados con secuencias específicas del genotipo del VPH, fueron dos copias/reacción para el VPH16, VPH18 y algunos genotipos del VPH de AR y 20 copias/reacción para los genotipos de VPH de AR, restantes.

El ensayo AmpFire falló en una muestra clínica con una tasa no válida del 0,5%. El ensayo AmpFire detectó el VPH en muestras clínicas con porcentajes de concordancia positiva de 100% para el VPH16, 100% para el VPH18 y 94,7% para el VPH no 16/18 de alto riesgo, y concordancias de porcentaje negativo de 100% para el VPH16, VPH18 y del VPH no 16/18 de AR. Es importante destacar que 53 de las muestras clínicas de FFPE fueron biopsias de la orofaringe. En los EUA, el 70% de los cánceres de orofaringe están relacionados con el VPH y se analizan con frecuencia muestras de biopsia frescas y conservadas para detectar el VPH.

Los autores concluyeron que se obtuvo una concordancia en la detección cualitativa en su estudio de reproducibilidad. En resumen, el ensayo Atila AmpFire HPV demostró una excelente sensibilidad analítica y especificidad para la detección y genotipificación de 15 genotipos de VPH de alto riesgo. Los parámetros de ensayo de procesamiento simple de muestras, requerimiento de tamaño de muestra pequeño, tiempo de respuesta rápido y estar cerca del instrumento lo hacen muy adecuado para la detección y genotipificación del VPH en muestras FFPE. El estudio fue publicado el 21 de enero de 2020 en la revista Journal of Molecular Diagnostics.

Enlace relacionado:
Centro de Cáncer Memorial Sloan Kettering
AtilaBiosystems
Roche