Eurofins Genomics lanza un servicio de secuenciación de próxima generación, optimizado y rentable, del SARS-CoV-2

Eurofins Genomics (Ebersberg, Alemania) lanzó un servicio de secuenciación de próxima generación optimizado y rentable, para el SARS-CoV-2, que proporciona secuencias genómicas virales de longitud completa.

La mejor mezcla ARTIC NGS Oligo de su clase, sintetizada por la rama de síntesis de Eurofins Genomics, también estará disponible comercialmente en breve. El nuevo servicio NGS y el kit oligo, ARTIC NGS, son las últimas incorporaciones de Eurofins a un portafolio de productos completo para ayudar a los investigadores de todo el mundo en el desarrollo de vacunas y en su lucha contra la pandemia de COVID-19.

La creciente diversidad de variantes del SARS-CoV-2 y la amenaza potencial de una mayor virulencia, mayor infectividad y epítopes alterados de estas cepas virales de nueva evolución, subrayan la necesidad de identificar, y rastrear mutaciones en todo el genoma viral. La secuenciación del genoma completo del SARS-CoV-2 identifica cepas mutantes y detecta los riesgos emergentes, incluidas las variantes potencialmente inmunes y evasivas de la vacuna, en una etapa temprana.

El servicio y la mezcla de oligo se basan en un protocolo del consorcio ARTIC, que se utiliza para la secuenciación del SARS-CoV-2 en todo el mundo. El método ARTIC utiliza un grupo de oligonucleótidos para la amplificación multiplexada por PCR del genoma viral completo. Eurofins Genomics optimizó la formulación del grupo de oligonucleótidos logrando el mayor rendimiento y la mejor uniformidad de cobertura de su clase para el genoma viral de longitud completa.

La sofisticada línea bioinformática de Eurofins Genomics reúne y compara las secuencias de aislamientos del SARS-CoV-2 de longitud completa, contiguas, resultantes y entrega un informe para una interpretación concluyente. El nuevo servicio aprovecha el sistema de gestión de información de laboratorio (LIMS) escalable, automatizado y estandarizado de Eurofins Genomics, controlado, en la instalación de secuenciación de próxima generación de alto rendimiento. Eurofins ofrece parte de su capacidad de secuenciación de forma gratuita a las autoridades sanitarias públicas que no tienen presupuestos de emergencia disponibles para detectar la cepa VUI2020-12/01 que, según se informa, se propaga rápidamente en el Reino Unido en sus muestras positivas, para que puedan evaluar la prevalencia local de esta nueva cepa.

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