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Nueva clase de diagnóstico de infecciones del torrente sanguíneo podría permitir identificación del organismo sin cultivo el mismo día

Por el equipo editorial de LabMedica en español
Actualizado el 29 Nov 2023
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Imagen: Keynome ID es un algoritmo patentado que clasifica las especies bacterianas presentes en una muestra (Fotografía cortesía de Day Zero Diagnostics)
Imagen: Keynome ID es un algoritmo patentado que clasifica las especies bacterianas presentes en una muestra (Fotografía cortesía de Day Zero Diagnostics)

La Organización Mundial de la Salud informa que las complicaciones relacionadas con la sepsis provocan 11 millones de muertes al año, lo que representa una quinta parte de todas las muertes mundiales. La sepsis, una infección grave, exige un tratamiento rápido y eficaz, ya que los riesgos de mortalidad aumentan con cada hora que pasa. Los métodos tradicionales de diagnóstico basados en cultivos, que tardan días en identificar patógenos y determinar la susceptibilidad a los antimicrobianos, contribuyen a un tratamiento excesivo o insuficiente, especialmente cuando se trata de organismos resistentes a los antibióticos. Esta situación subraya la necesidad urgente de tecnologías de diagnóstico rápido capaces de identificar patógenos y proporcionar resultados de susceptibilidad a los antimicrobianos en cuestión de horas, guiando así una terapia eficaz.

Oxford Nanopore (Oxford, Reino Unido) y Day Zero Diagnostics (Boston, MA, EUA) han iniciado una colaboración para desarrollar una solución de diagnóstico integral para las infecciones del torrente sanguíneo, una de las principales causas de sepsis. Esta colaboración buscará desarrollar un sistema de diagnóstico que ofrezca identificación de patógenos en el mismo día y perfiles de susceptibilidad a antibióticos basados en genómica sin necesidad de hemocultivos. Ambas empresas buscan optimizar este sistema para entornos clínicos, como hospitales, y planean obtener aprobaciones regulatorias, incluida la autorización de la FDA, en el futuro.

Este innovador sistema de diagnóstico combinará la tecnología avanzada de preparación de muestras de Day Zero Diagnostics, que enriquece enormemente las muestras, con su tecnología Keynome impulsada por IA. Keynome es experta en identificar microbios y determinar la susceptibilidad a los antibióticos. Este sistema se combinará con datos de secuenciación del PromethION 2 Solo de Oxford Nanopore, un dispositivo de secuenciación compacto de alto rendimiento. La asociación se centra en la creación de un flujo de trabajo automatizado para el procesamiento y la secuenciación de muestras que se adapte a las demandas operativas de los laboratorios de los hospitales clínicos. La plataforma PromethION 2 Solo de Oxford Nanopore, reconocida por sus capacidades en tiempo real, escalabilidad y precisión mejorada en la secuenciación de un solo nucleótido, es ideal para la identificación rápida y rentable de patógenos directamente de muestras clínicas.

"Nos complace lanzar esta colaboración con Oxford Nanopore que integra innovaciones de secuenciación de nanoporos con las tecnologías de plataforma de Day Zero Diagnostics para desarrollar una solución de diagnóstico para la sepsis, primera en su tipo", dijo Jong Lee, director ejecutivo y cofundador de Day Zero Diagnostics. "La identificación de organismos sin cultivo, el mismo día, y el perfil de susceptibilidad a los antimicrobianos directamente a partir de muestras nativas cambiarán las reglas del juego para el diagnóstico de enfermedades infecciosas, permitiendo directamente un tratamiento temprano y específico para salvar vidas de los pacientes".

"Estamos entusiasmados de asociarnos con Day Zero Diagnostics para llevar los beneficios de la secuenciación de nanoporos para combatir las infecciones del torrente sanguíneo", dijo Gordon Sanghera, director ejecutivo de Oxford Nanopore Technologies. "Nuestra esperanza es que los resultados rápidos, la alta precisión y la accesibilidad del sistema Oxford Nanopore, combinados con la experiencia y el flujo de trabajo de DZD, hagan posible que más personas tengan acceso a una solución rápida y eficaz en la lucha contra las infecciones del torrente sanguíneo".

Enlaces relacionados:
Oxford Nanopore
Day Zero Diagnostics

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