Optimizan diagnóstico molecular para muestras de tejido en cáncer de mama

Un ensayo pronóstico de análisis de 70 genes para el cáncer de mama en estadío temprano para los tejidos frescos ha estado disponible hasta el momento. Sin embargo, gracias a las mejoras en el procesamiento del ácido ribonucleico (ARN), ahora es posible el diagnóstico usando micromatrices para los tejidos en formol e incrustados en parafina (FFPE).

La prueba se basa en la medición exacta de la expresión genética mediante el análisis por microarray, y ha sido desarrollada y validada para tejidos tumorales frescos y congelados con el fin de garantizar ARN de alta calidad para el análisis. El análisis de la expresión genética usando tejido FFPE, ha sido retador desde hace mucho tiempo, debido a los protocolos de fijación no estandarizados y debido a la recuperación no confiable de ARN de buena calidad a partir de material FFPE debido a la fragmentación del ARN y la reticulación como resultado de la fijación con formalina.

Científicos de la Universidad de Turín (Italia) y colegas de otras organizaciones, optimizaron el ensayo en 157 muestras FFPE, y el análisis fue establecido utilizando 125 muestras correspondientes de FFPE y de tejido fresco. La validación de la prueba MammaPrint-FFPE (Agendia, Irvine, CA, EUA), fue comparada con la prueba MammaPrint-fresh de la compañía y se llevó a cabo en una serie independiente de tejidos correspondientes para 211 muestras procedentes de cinco hospitales.

El ensayo MammaPrint usando el analito FFPE demostró una equivalencia global de 91,5% entre las 211muestras tumorales independientes correspondientes de tejido FFPE y fresco. La precisión fue 97,3%, y la repetitividad fue de 97,8%, con resultados altamente reproducibles entre las muestras repetidas del mismo tumor y entre dos laboratorios. La precisión y la repetitividad del ensayo FFPE fueron evaluadas en un conjunto de cuatro muestras de diagnóstico que fueron procesadas y analizadas por duplicado durante 20 días consecutivos. MammaPrint mostró resultados muy estables en FFPE, con una estabilidad relativa muy alta para la precisión.

Los autores concluyeron que la prueba MammaPrint se puede utilizar en cortes centrales y quirúrgicos de tejido FFPE como una alternativa al uso de tejido fresco. El ensayo MammaPrint-FFPE tiene una reproducibilidad, precisión y repetitividad excelentes y tiene un desempeño muy similar al de la prueba MammaPrint-fresh. El estudio fue publicado el 28 de diciembre de 2013, en la revista Journal of Molecular Diagnostics.

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