Mejor predicción de recaída del cáncer mediante secuenciación de ADN de alta eficiencia

Los investigadores han mostrado que la secuenciación de alta eficiencia (HTS) detecta los signos más precoces conocidos de la recaída potencial del cáncer y en casi el doble del número de pacientes que la citometría de flujo, el estándar de oro actual para detectar la enfermedad residual mínima (MRD).

Específicamente, se aplicó la tecnología emergente usando HTS de los genes receptores linfoides para el diagnóstico de la leucemia/linfoma linfoide aguda de linaje T. El estudio colaborativo liderado por científicos en el Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson (Hutchinson Center; Seattle, WA, EUA), comparó la efectividad de dos métodos para detectar la MRD un factor predictivo importante de recaída del cáncer, en 43 pacientes con diagnóstico de leucemia linfoide aguda T, que es más común en niños menores de 4 años. Los pacientes mostraron que secuenciando los genes receptores de las células T, del paciente, antes y 29 días después de la quimioterapia, su presencia en sangre podía ser medida con precisión y suministraba una predicción más exacta de la recaída de la leucemia. La HTS detectó la MRD en 22 pacientes, mientras que la MRD fue detectada en solo 12 pacientes, con citometría de flujo, actualmente el método primario para detectarla en los Estados Unidos. Estos, y otros resultados de este estudio que representa el primer uso de la HTS para detectar la MRD en un ensayo clínico, encontró que la HTS era, por lo menos, 20 veces más sensible que la citometría de flujo, para detectar la MRD.

“Nuestra investigación indica que la HTS ofrece muchas ventajas sobre la citometría de flujo”, dijo Harlan Robins, PhD, miembro asociado del Centro Hutchinson. “Puesto que la HTS puede detectar cualquier clon preidentificado y se realiza en un laboratorio centralizado, genera, consistentemente, resultados reproducibles y confiables independientemente del tipo de cáncer, utilizando el mismo proceso para la detección de la enfermedad y el seguimiento. Por otra parte, la HTS es altamente automatizada, eficiente y objetiva, mientras que la citometría de flujo es más lenta, se basa en la habilidad del operador, y por lo tanto está sujeta a error humano”, explicó Robins.

“La capacidad de predecir recaída de la enfermedad antes con la secuenciación de alto rendimiento les daría a los hematólogos la opción de tratar la recurrencia del cáncer antes, ofreciendo una mayor posibilidad de supervivencia. A largo plazo, esta tecnología también podría ser utilizada para diagnosticar inicialmente la leucemia y el linfoma mucho antes de lo que podemos hoy”, agregó el Dr. Robbins.

El Dr. Robins y sus colegas habían adaptado la tecnología tradicional de alto rendimiento para secuenciar específicamente sólo las regiones variables de los genes receptores de las células T y B. El Centro Hutchinson tiene patentes pendientes para las tecnologías básicas, licenciadas exclusivamente a Adaptive Biotechnologies (Seattle, WA, EUA), que fueron empleadas en conjunto con la HTS utilizada para este estudio.

Los resultados del estudio fueron publicados en la edición de 16 de mayo 2012, de la revista Science Translational Medicine.

Enlace relacionados:

Fred Hutchinson Cancer Research Center

Adaptive Biotechnologies

University of Washington