Nuevo kit de extracción permite aislamiento consistente y escalable de ADNlc de biofluidos

El ADN circulante libre de células (ADNlc) presente en plasma, suero, orina y líquido cefalorraquídeo suele estar presente en bajas concentraciones y suele estar muy fragmentado, lo que dificulta su recuperación eficiente para el descubrimiento de biomarcadores y el desarrollo de diagnósticos. Los laboratorios también requieren métodos de extracción escalables que se adapten a volúmenes de entrada variables y múltiples biofluidos, preservando al mismo tiempo la reproducibilidad y la eficiencia del flujo de trabajo. Un nuevo kit de extracción aborda estas necesidades al permitir el aislamiento consistente y automatizado de ADNlc de biofluidos de uso común.

New England Biolabs (Ipswich, MA, EUA) ha lanzado el kit de extracción de ADN libre de células (ADNlc) Monarch Mag para el aislamiento de ADN circulante de baja abundancia de diversos biofluidos. El kit admite aportes de plasma, suero, orina y líquido cefalorraquídeo de 1 a 4 ml. Está diseñado para flujos de trabajo que abarcan desde el procesamiento manual hasta un mayor rendimiento con automatización, y para su uso previo a aplicaciones como el descubrimiento de biomarcadores y el desarrollo de diagnósticos.

La tecnología emplea un enfoque basado en microesferas magnéticas que combina química especializada con partículas magnéticas recubiertas de sílice para recuperar eficientemente fragmentos cortos de ADN de matrices complejas, incluyendo aquellas con alta actividad de nucleasas. Diseñado para la automatización, el flujo de trabajo optimizado proporciona ADNlc consistente y concentrado, ideal para una amplia gama de análisis moleculares posteriores. El rendimiento reportado demuestra la recuperación en todo el espectro de tamaños de fragmentos, incluyendo fragmentos de hasta 50 pares de bases.

Para los laboratorios que buscan optimizar el proceso de obtención de resultados, el kit se complementa con los productos de amplificación y preparación de bibliotecas de la compañía, incluyendo la gama NEBNext para la preparación de bibliotecas de secuenciación de nueva generación. El formato ofrece versatilidad en cuanto a número de muestras, cantidades de entrada y tipos de muestra, manteniendo la reproducibilidad. Las actualizaciones de empaquetado de la gama Monarch reducen el uso de plástico en las botellas de reactivos y componentes de empaquetado en comparación con las soluciones estándar del mercado.

“Extraer ADN libre celular es un desafío singular debido a su alta fragmentación y a su baja concentración en matrices de biofluidos complejas y variables”, afirmó Anagha Kadam, Científica de Aplicaciones y Desarrollo de Productos II del NEB. “El kit utiliza una química especializada y microesferas magnéticas recubiertas de sílice para recuperar eficazmente fragmentos cortos de ADN de muestras complejas que presentan una alta actividad nucleasa”.

“Ir de un proveedor a otro para solucionar un problema es agotador e ineficiente”, afirmó James Deng, gerente sénior de marketing de productos de NEB. “Con un kit de extracción de ADNlc que se integra a la perfección con nuestras soluciones de secuenciación y amplificación posteriores, podemos abordar de forma más integral los desafíos de los clientes, desde la preparación de muestras hasta las aplicaciones de diagnóstico molecular”.

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