Prueba rápida de CRISPR identifica micobacterias no tuberculosas en muestras respiratorias

Estas infecciones pueden afectar hasta a 300.000 estadounidenses al año, con una mortalidad a cinco años cercana al 18%.

Identificar la especie causante suele requerir flujos de trabajo de cultivo lentos que pueden tardar de cuatro a seis semanas, lo que prolonga la incertidumbre y retrasa la terapia adecuada. Para acelerar este proceso, los investigadores han desarrollado una plataforma basada en CRISPR que identifica especies micobacterianas directamente a partir de muestras respiratorias en cuestión de horas.

Investigadores de la Universidad de Tulane (Nueva Orleans, LA, EE. UU.) desarrollaron CANDI (identificación diferencial de nanogotas asistida por CRISPR) para acelerar el diagnóstico a nivel de especie de la enfermedad pulmonar causada por MNT. La plataforma utiliza moco pulmonar y otros fluidos respiratorios para analizar simultáneamente hasta 15 especies y subespecies de MNT clínicamente relevantes. Por su diseño, permite una identificación definitiva de la especie en cuestión de horas, en lugar de las cuatro a seis semanas que requieren los métodos convencionales basados en cultivo.

En un estudio que evaluó 230 muestras clínicas, CANDI identificó correctamente especies y subespecies de MNT con una precisión del 97,3%. El enfoque se desarrolló para distinguir entre una amplia gama de micobacterias ambientales que pueden causar infecciones crónicas similares a la tuberculosis, ayudando a los clínicos a seleccionar los tratamientos adecuados. 

Como los síntomas se superponen con los de la tuberculosis y los requisitos de tratamiento difieren, un diagnóstico erróneo puede retrasar la atención adecuada durante meses. La enfermedad afecta de manera desproporcionada a los adultos mayores, las personas con afecciones pulmonares subyacentes y los pacientes inmunodeprimidos.

Las tendencias también apuntan a una prevalencia más alta y en aumento en el sur de Estados Unidos a medida que aumentan la temperatura y la humedad, lo que subraya la necesidad de una identificación de especies más rápida y multiplexada.

La novedad de la plataforma podría permitir, según el equipo, su expansión más allá de las MNT a otras infecciones difíciles de diagnosticar. Los detalles del ensayo y la validación se publicaron en Science Translational Medicine el 16 de septiembre de 2026.

“Diagnosticar la enfermedad pulmonar por MNT es muy lento, y los pacientes quedan con una carga física y emocional considerable porque no saben cuál es la respuesta ni cuál debería ser el plan de tratamiento. Los clínicos necesitan una prueba más rápida que les permita identificar con precisión el tipo específico de bacteria que está causando la enfermedad pulmonar del paciente”, dijo el investigador principal Bo Ning, profesor asistente de biología molecular en la Escuela de Medicina de Tulane University.

“La enfermedad pulmonar por MNT es cada vez más común, y el enfoque de detección actual es tan difícil que los pacientes terminan sufriendo. Este nuevo método ayudará a los clínicos a iniciar antes el tratamiento adecuado”, dijo Ning.

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Escuela de Medicina de Tulane University