Una plataforma de cribado ultrasensible detecta las bacterias patógenas

Estas sondas genéticas se introducen junto con el material tomado de la muestra que se analiza. Un proceso magnético aísla segmentos de la muestra que coinciden con la sonda, y estos segmentos se analizan utilizando una secuenciación de alto rendimiento.

El uso de la prueba BacCapSeq, de 70 horas, dio como resultado un aumento de hasta 1.000 veces en las lecturas de bacterias de las muestras de sangre y redujo el límite de detección en uno o dos órdenes de magnitud en comparación con la secuenciación convencional de alto rendimiento no sesgada. En este nivel de sensibilidad, la prueba detectó no solo la presencia de genes AMR sino también biomarcadores para AMR que incluían transcripciones constitutivas y expresadas diferencialmente.

“La inteligencia microbiológica debe ser un componente integral de la medicina de precisión”, dijo el autor principal, el Dr. W. Ian Lipkin, profesor de epidemiología en la Universidad de Columbia. “El diagnóstico precoz y exacto de las enfermedades infecciosas y el conocimiento de los perfiles de sensibilidad a los medicamentos reducirán la mortalidad, la morbilidad y los costos de la atención médica”.

La plataforma de diagnóstico BacCapSeq fue descrita en la edición en línea de la revista mBio del 23 de octubre de 2018.

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Universidad de Columbia