Prueba diagnóstica detecta con precisión cáncer colorrectal al identificar firma microbiana en bacterias intestinales

Los métodos de cribado actuales, como la colonoscopia, son invasivos y requieren muchos recursos, lo que limita los esfuerzos de detección temprana. El vínculo entre el microbioma intestinal y el cáncer colorrectal se identificó por primera vez hace varios años. Ciertas bacterias presentes en la microbiota intestinal tienen la capacidad de interferir con los procesos celulares humanos y se cree que contribuyen al desarrollo del cáncer con el tiempo. En algunos casos, esto se debe a su producción de toxinas que pueden dañar el ADN, provocando mutaciones, uno de los principales factores desencadenantes del cáncer. Esto sugiere que la microbiota intestinal podría contribuir a crear condiciones que promuevan la aparición de la enfermedad. Los investigadores han estado trabajando para utilizar el microbioma intestinal como diana clínica para el cribado del cáncer colorrectal. Idealmente, esto permitiría el uso de análisis de heces simples para la detección temprana de la enfermedad, en lugar de procedimientos costosos como las colonoscopias. Ahora, un equipo de investigación internacional ha identificado una firma microbiana única en muestras de heces que podría conducir a una prueba de detección no invasiva y de alta precisión basada en el análisis del microbioma intestinal.

El estudio multidisciplinario, coordinado por la Universidad de Trento (Trento, Italia), se basó en la experiencia del equipo en microbiología, biología computacional y oncología para explorar el potencial de la metagenómica intestinal en la detección del cáncer. Los investigadores descubrieron que un grupo específico de alrededor de una docena de especies bacterianas aparece sistemáticamente en mayor número en los intestinos de las personas con cáncer colorrectal. Entre las bacterias bien conocidas se encuentra Fusobacterium nucleatum, junto con otras como Parvimonas micra, Gemella morbillorum y Peptostreptococcus stomatis. Estas bacterias suelen estar presentes en las bocas de las personas sanas, pero su presencia en muestras de heces parece estar fuertemente asociada con el cáncer colorrectal. Esta firma microbiana, identificada mediante secuenciación metagenómica intestinal, alcanzó una precisión de casi el 90 % al distinguir entre individuos sanos y aquellos con la enfermedad. En particular, la presencia y abundancia de estas bacterias también se correlacionan con el estadio del cáncer y la ubicación anatómica, lo que ofrece conocimientos clínicos adicionales.

Un componente crucial de este avance fue la aplicación de un novedoso marco de aprendizaje automático desarrollado por el equipo de investigación. El modelo interpreta patrones complejos del microbioma en muestras de heces para predecir la presencia de cáncer con alta fiabilidad. Si bien el estudio se centra principalmente en la detección temprana, la firma microbiana también puede ofrecer pistas sobre los mecanismos de la enfermedad. Algunas de estas bacterias pueden promover el desarrollo del cáncer al producir toxinas que dañan el ADN, lo que subraya aún más la compleja relación entre el microbioma y la carcinogénesis. Sin embargo, los investigadores enfatizan que, incluso sin establecer causalidad, el valor de esta herramienta como método de cribado sigue siendo significativo. Si se valida mediante futuros ensayos clínicos, este enfoque podría complementar o reemplazar parcialmente procedimientos invasivos, como las colonoscopias, al permitir su uso solo en individuos de alto riesgo identificados mediante el cribado del microbioma. Esto agilizaría la detección del cáncer, mejoraría la comodidad del paciente y potencialmente permitiría un tratamiento más temprano.