Genotipo APOE estratifica la enfermedad de Alzheimer

La enfermedad de Alzheimer (EA), también llamada simplemente Alzheimer, es una enfermedad neurodegenerativa crónica que generalmente comienza lentamente y empeora gradualmente con el tiempo. Es la causa del 60% al 70% de los casos de demencia.

La apolipoproteína E (APOE) es una proteína involucrada en el metabolismo de las grasas en el cuerpo. Está implicada en la enfermedad de Alzheimer y en la enfermedad cardiovascular. El gen APOE fue ubicado en el cromosoma 19 en un grupo con la apolipoproteína C1 (APOC-I) y la apolipoproteína C2 (APOC-2).

Un equipo internacional de científicos dirigido por los de facultad de medicina de la Universidad de Boston (Boston, MA, EUA) examinó los datos de la secuencia del exoma de 5.522 individuos no relacionados con EA y más de 4.900 individuos de control cognitivamente normales, todos con ascendencia blanca no-hispana. Después de los pasos de los controles de calidad, quedaron datos para 2.377 casos de EA y 706 controles aún no afectados que tenían el alelo APOE4, junto con datos que representan a 3.145 personas con EA y más de 4.200 individuos control que no tenían la versión, relacionada con la EA, de APOE.

El equipo intentó validar posibles contribuyentes de EA usando datos para dos cohortes más: datos del exoma para otros 1.766 individuos con EA y 2.906 sin la enfermedad, así como de 8.728 individuos afectados por la EA y 9.808 controles evaluados por genotipificación basada en arrays. El equipo rastreó hasta 22 variantes con posibles vínculos con el riesgo de EA. Usando el grupo de descubrimiento y un metaanálisis realizado en combinación con los datos de las cohortes de replicación, por ejemplo, vieron un polimorfismo de nucleótido único (SNP) potencialmente protector en el locus ISYNA1 para quienes portan el alelo APOE relacionado con la EA.

En el grupo libre de APOE4, por otro lado, el análisis del equipo destacó posibles SNP asociados a la EA en AC099552 y en GPAA1, entre otros, incluida una variante llamada rs138412600 que parece influir en la expresión de GPAA1 y un factor de transcripción represivo relacionado llamado FOXG1 en el cerebro. En el grupo de casos y controles que carecen del alelo APOE ε4 de alto riesgo, los científicos también identificaron SNP con asociaciones más débiles en o alrededor de los genes previamente implicados en el riesgo de EA, incluidos MAPT y TREM2.

Los autores concluyeron que su estudio identificó múltiples asociaciones novedosas posibles para la EA con variantes raras individuales y agregadas en grupos de individuos con y sin alelos APOE ε4 que refuerzan los conocidos y sugieren vías adicionales que conducen a la EA. El estudio fue publicado el 10 de junio de 2019 en la revista JAMA Neurology.

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Facultad de Medicina de la Universidad de Boston