Panel multiplex hace su debut para la detección de infecciones resistentes a múltiples medicamentos

Un panel resistente a múltiples medicamentos (MDR) detecta firmas genéticas de resistencia a antibióticos específicos en patógenos que comúnmente se consideran adquiridos en el hospital. El panel fue diseñado para uso como una prueba de detección para el control de infecciones y el aislamiento de portadores asintomáticos.

Se ha presentado un nuevo panel de reacción en cadena de polimerasa cuantitativa multiplexada (qPCR) para detectar infecciones resistentes a múltiples fármacos. El panel puede detectar todos los objetivos de un solo frotis rectal y tiene un desempeño que podría permitir a los hospitales evaluar a todos los pacientes que ingresan para garantizar que no estén colonizados.

El ensayo utiliza una tecnología patentada de ChromaCode (Carlsbad, CA, EUA), llamada PCR de alta definición, que emplea químicos nuevos y algoritmos de aprendizaje automático, incluida la detección de múltiples objetivos en un solo canal de fluorescencia mediante la restricción de las concentraciones de las sondas. Los métodos permiten a la empresa desarrollar kits multiplexados de un solo tubo, con hasta cuatro objetivos para cada canal de color en un instrumento qPCR, lo que equivale a hasta 20 objetivos para un instrumento de cinco canales. Los kits también emplean un formato de placa de 96 pozos, que permite a los usuarios escalar las pruebas.

El ensayo MDR detecta específicamente genes que confieren resistencia en bacterias, incluidas bacterias gramnegativas y Clostridium difficile toxigénico. Específicamente, en una sola reacción detectará el marcador CTX-M, que confiere resistencia a las betalactamasas de espectro extendido; los marcadores IMP, KPC, NDM, OXA-48 y VIM que confieren resistencia, cada uno a los antibióticos carbapenemasas; el marcador MCR-1 para resistencia a polimixina; y vanA para la resistencia a la vancomicina en la bacteria Enterococci. El panel también detectará el gen de la toxina B de C. difficile, una bacteria grampositiva que es un problema en los hospitales.

Se generaron y analizaron por triplicado un total de 19 muestras de frotis rectal simulado de cuatro presencias triples con MDR, y el rendimiento fue alto para estas muestras con genes de resistencia múltiple. El límite de detección para cada uno de los nueve objetivos MDR fue de entre 3 y 30 copias por reacción en 144 muestras añadidas, y los estudios iniciales de inclusividad también mostraron que la prueba además detecta muchos subtipos diferentes de cada gen de resistencia. La prueba se realizó en una gama de instrumentos qPCR estándar, el ABI 7500 Fast, el ViiA7 y el QuantStudio7 (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, EUA), además del Roche LC480 (Roche Life Science, Penzberg, Alemania) y los resultados fueron analizados en el software ChromaCode Cloud de la compañía. El ensayo se presentó en el congreso anual de la Asociación de Patología Molecular celebrado el 6 de noviembre de 2019 en Baltimore, MD, EUA.

Enlace relacionado:
ChromaCode
Thermo Fisher Scientific
Roche Life Science