Instalarán plataforma de identificación de proteínas en China

Una plataforma de software para la identificación y caracterización de proteínas y péptidos con datos de espectrometría de masas (MS) será instalada en China.

La plataforma, llamada Phenyx fue diseñada específicamente para satisfacer las demandas del análisis de datos de la MS de alta eficiencia y la evaluación de resultados dinámicos, y suministrar una experiencia de usuario flexible y una arquitectura adaptable para dar confianza en la evaluación de resultados.

Geneva Bioinformatics (GeneBio; Ginebra, Suiza; www.genebio.com) AS y el Laboratorio Clave Estatal de Proteómica Chino (Beijing, China) han anunciado que la plataforma de identificación de proteínas Phenyx de GeneBio será instalada en el Acúmulo (32 nodos) de Computación de Alta Eficiencia del Laboratorio Clave Estatal de Proteómica Chino.

El director del Laboratorio de Proteómica Clave Estatal Chino, Prof. Fuchu He, también es codirector del Proyecto de Proteoma Hepático Humano de la Organización del Proteoma Humano (HUPO HLPP). El acuerdo de licencia es un vínculo adicional entre GeneBio y varios proyectos HUPO, incluyendo la Iniciativa de Estándares de Proteómica y el Proyecto del Proteoma Cerebral HUPO.

"Estamos muy complacidos de estar trabajando con GeneBio y el SIB [Instituto Suizo de Bioinformática] y creemos que Phenyx es la plataforma correcta para nuestro acúmulo”, dijo el Prof. Yunping Zhu del Laboratorio Clave de Proteómica Estatal Chino. "Nuestro laboratorio está muy interesado de suministrar los mejores resultados posibles a nuestra comunidad, y por esto, era obvio que la adición de las capacidades de Phenyx eran obligatorias. La calidad de los resultados de identificación junto con la serie de características que el software suministra, entre las que se incluyen la posibilidad de comparar resultados de los motores de búsqueda principales, fueron factores importantes para tomar la decisión.

La plataforma Phenyx puede ser usada para aplicaciones clínicas si una prueba diagnóstica requiere la espectrometría de masas y una herramienta de identificación de proteínas y péptidos con MS. Por lo tanto, si el instrumento es usado en el modo de análisis de productos iónicos (MS/MS) podrá inferir o validar la presencia de un péptido diagnóstico dado.

Geneva Bioinformatics (GeneBio) SA es una compañía de bioinformática que suministra a la comunidad de ciencias biológicas un software de proteómica que cierra la brecha entre la adquisición de información y la generación de conocimiento. Su experticia se concentra en la identificación de proteínas y la caracterización así como en la imagenología de péptidos, ofreciendo a los clientes y socios el alto grado de especialización esencial para la investigación en proteómica.

El Laboratorio de Proteómica Clave Estatal Chino se concentra en la aplicación básica y la investigación de proteómica. Es el único laboratorio clave estatal en el campo de la proteómica en China. Los intereses científicos incluyen la red funcional y de proteoma de tejidos/órganos claves en humanos, el estudio proteómico de enfermedades claves, biología de sistemas basada en proteómica y técnicas novedosas de proteómica.