Importancia de controles de alta calidad en diseño y desarrollo de nuevos análisis

El uso de controles biológicos bien definidos en el desarrollo de un análisis como un factor esencial para determinar la confiabilidad y reproducibilidad de los datos obtenidos con aplicaciones moleculares se examinó a fondo en un taller durante la Reunión Anual de 2013 de la AMP.

La Colección Americana de Cultivos Tipo (ATCC; Manassas, VA, EUA) discutió sobre este tema durante su primera participación en la Jornada de Taller Corporativo en la reunión anual de 2013 (noviembre) de la Asociación para Patología Molecular (Phoenix, AZ, EUA). Se hizo hincapié en la importancia de la utilización de materiales biológicos validados y altamente caracterizados para el desarrollo y la verificación de un análisis. Más de 75 representantes de empresas farmacéuticas y de diagnóstico molecular asistieron al taller. La presentación se dividió en dos partes, centrándose la primera en los controles para las mutaciones genéticas en la biología del cáncer, seguida de una discusión sobre la caracterización detallada de las cepas de enfermedades infecciosas y los controles de ácidos nucleicos de la ATCC.

Fang Tian, PhD, Científica Principal de Sistemas de Células de la ATCC, dirigió la discusión, describiendo la escena rápidamente cambiante del diagnóstico, incluyendo la gran cantidad de datos genéticos humanos que está disponible actualmente a través del acceso abierto. Por otra parte, con el desarrollo de tecnologías de secuenciación más pequeñas, más rápidas y más asequibles, los investigadores ahora requieren de una fuente estable y renovable de controles, tales como líneas de células completamente caracterizadas y autenticadas. Para satisfacer estas necesidades, la ATCC ha organizado Paneles de Células Tumorales que representan líneas celulares agrupadas por tipo de tejido y que muestran los datos publicados de las mutaciones de los genes. Además, la Dra. Tian explicó, “La ATCC no es sólo el emparejamiento de líneas celulares con los datos publicados de la mutación de sus genes. También estamos realizando un extenso análisis de laboratorio para confirmar la presencia, la estabilidad y la expresión de las mutaciones genéticas utilizando herramientas como la secuenciación, la PCR [reacción en cadena de la polimerasa] y la inmunotransferencia de Western”.

Liz Kerrigan, Directora de Normas de la ATCC señaló: “es imprescindible obtener los controles de una fuente confiable, conocer cómo se producen y cómo se verificaron las identidades: eso es lo importante de la autenticación”. Además de ofrecer pruebas complementarias para las líneas celulares tumorales, la ATCC también realiza análisis integrales sobre aislamientos de enfermedades infecciosas de gran diversidad geográfica para determinar el serotipo, el toxinotipo, y los perfiles de resistencia múltiple (MDR).

A medida que cambian las herramientas disponibles para los laboratorios, la ATCC se está adaptando para que sea más fácil localizar los datos genéticos y fenotípicos relacionados con los controles necesarios para probar el diseño de los análisis y para verificar los resultados. La ATCC ofrece una creciente lista de Paneles de Células Tumorales, Paneles de Alteración Genética, cepas de enfermedades infecciosas y resistentes a diversos fármacos, ácidos nucleicos naturales y sintéticos y Materiales de Referencia Certificados (CRM), incluyendo el CRM más reciente para la mutación KRAS, para el desarrollo, realización de pruebas de inclusión y exclusión y determinación de límites de detección (LOD) de los análisis.

Enlace relacionado:

American Type Culture Collection (ATCC)