Firma genética determina comportamiento metastásico en timomas

Treinta y seis muestras fueron seleccionadas para el conjunto de entrenamiento en base al tiempo más corto y más largo hasta la metástasis. Las muestras restantes fueron incluidas en el conjunto de validación. Los bloques estaban compuestos enteramente de tumor en todos menos tres casos y el ácido ribonucleico (ARN) fue extraído a partir de cinco cortes de 10 micras de espesor.

El análisis de Predicción de Microarrays (PAM) identificó 10 genes asociados con la metástasis y 9 genes asociados con la etapa de la neoplasia. Se realizó reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real cuantitativa (QRT-PCR) para analizar los 19 genes discriminantes, relacionados tanto con las metástasis como con el estadío y 4 genes de control, en muestras de timoma primario, fijadas en formol e incluidas en parafina (FFPE). La prueba genética se llama DecisionDx-timoma (Castle Biosciences, Phoenix, AZ, EUA) y se realizó en el Hospital y el Centro Médico de San José (Phoenix, AZ, EUA). En el conjunto de entrenamiento, las tasas de supervivencia de cinco y 10 años sin metástasis años fueron de 77% para la Clase 1 de bajo riesgo de metástasis, predicha y de 26% para la Clase 2, de alto riesgo para la metástasis.

Sunil Badve, MD, FRCPath, profesor de patología y medicina de laboratorio y autor principal, dijo: “Nuestros estudios establecieron y validaron una firma de nueve genes que predice la probabilidad de metástasis, con mayor exactitud, que los métodos de estatificación tradicionales, incluyendo Masaoka y la extensión de la resección quirúrgica. Dado que las directrices actuales recomiendan una radioterapia adyuvante y quimioterapia para todos los pacientes resecados con timomas, en estadio II/III, esto puede conducir a un tratamiento de pacientes con tumores agresivos diagnosticados en una etapa temprana, y el tratamiento exagerado de los tumores de crecimiento lento, diagnosticados en una etapa posterior”.

Los autores concluyeron que el desarrollo y la validación de un ensayo pronóstico de nueve genes sirve como un factor predictivo, independiente, de supervivencia libre de metástasis y parece superior a los pronosticadores que actualmente se utilizan como el estadío de Masaoka y la histología. El estudio actual proporciona un modelo útil para la aplicación eficiente de los datos de expresión genética para el beneficio del paciente, especialmente en enfermedades raras. El estudio fue publicado el 24 de julio de 2013, en la revista Public Library of Science ONE.

Enlaces relacionados:

Indiana University School of Medicine

St. Joseph's Hospital and Medical Center

Castle Biosciences