Innovador método de 'fragmentómica' podría permitir detección más temprana del cáncer mediante extracciones de sangre más pequeñas

Cuando las células mueren, se desintegran y liberan parte de su material de ADN al torrente sanguíneo. Este ADN libre celular (ADNlc) contiene señales de cáncer. El ADNlc de células sanas se descompone en fragmentos de tamaño estándar, mientras que los fragmentos de ADNlc cancerosos se desintegran en diferentes lugares, a menudo en las regiones repetitivas del genoma. En lugar de buscar mutaciones específicas del ADN, que es como encontrar una sola letra desordenada entre miles de millones de letras, los investigadores han desarrollado un novedoso método de aprendizaje automático. Este método detecta variaciones en los patrones de fragmentación entre el ADClc canceroso y normal en estas regiones repetitivas del cáncer. Esta técnica innovadora podría permitir la detección más temprana del cáncer en pacientes mediante muestras de sangre más pequeñas, ya que requiere aproximadamente ocho veces menos sangre que la que se necesita para la secuenciación del genoma completo.

El algoritmo llamado Alu Profile Learning Using Sequencing (A-Plus) fue desarrollado por investigadores de City of Hope (Duarte, CA, EUA) y el Instituto de Investigación de Genómica Traslacional (TGen, Phoenix, AZ, EUA). Los investigadores probaron el algoritmo en 7.657 muestras de 5.980 personas, 2.651 de las cuales fueron diagnosticadas con cánceres como el de mama, colon y recto, esófago, pulmón, hígado, páncreas, ovario o estómago. Descubrieron que A-Plus podía identificar aproximadamente la mitad de los cánceres de los 11 tipos estudiados. La prueba demostró ser muy precisa y arrojó sólo un falso positivo por cada 100 pruebas realizadas.

Significativamente, la mayoría de las muestras de cáncer provinieron de personas con enfermedad en etapa temprana, que tenían pocas o ninguna lesión metastásica en el momento del diagnóstico. En el futuro, está previsto que comience un ensayo clínico en el verano de 2024 para comparar la eficacia de este método de análisis de sangre fragmentómico con el estándar de atención en adultos de 65 a 75 años. El objetivo es evaluar qué tan bien este panel de biomarcadores puede detectar el cáncer en una etapa más temprana y tratable.

"Una gran cantidad de evidencia muestra que el cáncer detectado en etapas posteriores mata a las personas", dijo Cristian Tomasetti, Ph.D., autor correspondiente del nuevo estudio y director del Centro para la Prevención y Detección Temprana del Cáncer de City of Hope. "Esta nueva tecnología nos acerca a un mundo en el que las personas recibirán un análisis de sangre anualmente para detectar el cáncer más temprano, cuando es más tratable y posiblemente curable".

"Nuestra técnica es más práctica para aplicaciones clínicas, ya que requiere cantidades más pequeñas de material genómico de una muestra de sangre", añadió Kamel Lahouel, Ph.D., profesor asistente en la División de Genómica Integrada del Cáncer de TGen y coprimer autor del estudio. "El éxito continuo en esta área y la validación clínica abren la puerta a la introducción de pruebas de rutina para detectar el cáncer en sus primeras etapas".

Enlaces relacionados:
City of Hope
TGen, Phoenix

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