Análisis de ARN de hisopos nasales diagnostica infección por virus respiratorios

Se ha demostrado que un panel de tres ARNm es capaz de predecir la presencia de infección por virus respiratorios en muestras nasales con una exactitud del 97%.

A pesar de la alta carga de infección respiratoria y la importancia de un diagnóstico precoz y exacto, en este momento no existe una prueba de diagnóstico simple para descartar una infección viral como la causa de los síntomas respiratorios.

Para llenar este vacío, los investigadores de la Universidad de Yale (New London, CT, EUA) realizaron ARNSeq en células epiteliales nasales humanas después de la estimulación del receptor de reconocimiento viral intracelular RIG-I. A continuación, evaluaron si la medición de los ARNm y las proteínas del huésped identificados, de los hisopos nasofaríngeos de los pacientes, podría predecir la presencia de un virus respiratorio en la muestra. Las muestras se obtuvieron de pacientes que eran principalmente adultos mayores o niños pequeños, lo que refleja la población analizada para detectar virus respiratorios en el sistema de salud.

La prueba ARNSeq (secuenciación de ARN) utiliza la secuenciación de próxima generación (NGS) para revelar la presencia y la cantidad de ARN en una muestra biológica en un momento dado en el tiempo. Esta técnica se usa para analizar el transcriptoma celular en constante cambio. Específicamente, el ARNSeq facilita la capacidad de examinar transcripciones de genes alternativos empalmados, modificaciones postranscripcionales, fusión génica, mutaciones/SNP y cambios en la expresión génica a lo largo del tiempo, o diferencias en la expresión génica en diferentes grupos o tratamientos. Además de las transcripciones de ARNm, el ARNSeq puede observar diferentes poblaciones de ARN para incluir el ARN total, el ARN pequeño, como el miARN, el ARNt y el análisis ribosómico.

Los investigadores inicialmente mostraron que una firma de tres ARNm, CXCL10, IFIT2 y OASL, predijo la detección de los virus respiratorios con una exactitud del 97% y que las proteínas identificadas se correlacionaban con la detección del virus. En un estudio de seguimiento, los niveles elevados de proteína CXCL11 o CXCL10 identificaron las muestras que contenían virus respiratorios, incluidos los virus que no estaban en el panel de análisis inicial.

“Es una prueba más simple y más rentable para detectar una infección viral”, dijo la autora principal, la Dra. Ellen Foxman, profesora asistente de medicina de laboratorio en la Universidad de Yale. “En lugar de buscar virus individuales, nuestra prueba hace la pregunta: “¿El cuerpo combate un virus?” Descubrimos que podemos responder muy bien a esa pregunta. Una razón para realizar la prueba es saber por qué el paciente está enfermo. La otra razón es tomar una decisión sobre si las personas que no están tan enfermas deben recibir antibióticos”.

La prueba del virus respiratorio se describió en la edición digital del 21 de diciembre de 2017 de la revista The Journal of Infectious Diseases.