Utilizamos cookies para comprender de qué manera utiliza nuestro sitio y para mejorar su experiencia. Esto incluye personalizar el contenido y la publicidad. Para más información, Haga clic. Si continua usando nuestro sitio, consideraremos que acepta que utilicemos cookies. Política de cookies.
Please note that the LabMedica website is also available in a complete English version
Presenta Sitios para socios Información LinkXpress
Ingresar
Publique su anuncio con nosotros
RANDOX LABORATORIES

Download Mobile App




Los depósitos de tejido residual son adecuados para los análisis proteómicos usando la espectrometría de masas

Por el equipo editorial de Labmedica en español
Actualizado el 18 Sep 2018
Print article
Imagen: El espectrómetro de masas cuadrupolo-orbitrap híbrido Q Exact (Fotografía cortesía de Thermo Fisher Scientific).
Imagen: El espectrómetro de masas cuadrupolo-orbitrap híbrido Q Exact (Fotografía cortesía de Thermo Fisher Scientific).
La proteómica basada en la espectrometría de masas se ha convertido en una poderosa herramienta para la identificación y cuantificación de proteínas de una amplia variedad de muestras biológicas.

La mayoría de los estudios que utilizan muestras de tejido se han realizado en muestras incrustadas congeladas frescas u óptimas de corte (OCT) recogidas de forma prospectiva. Sin embargo, este tipo de muestras son a menudo difíciles de obtener, tienen un suministro limitado, y la información clínica y los resultados en los pacientes se retrasan inherentemente en comparación con las muestras almacenadas.

Científicos del Laboratorio Nacional del Noroeste del Pacífico (Richland, WA, EUA) y sus colegas analizaron 60 muestras de pacientes tomadas de depósitos de tejido residual de Vigilancia, Epidemiología y Resultados Finales (SEER) del NCI, que contienen muestras de más de 100.000 pacientes con cáncer, junto con información demográfica detallada, datos sobre las características del tumor, el tratamiento, la supervivencia y la causa de la muerte. Las 60 muestras variaron en su tiempo de almacenamiento de siete a 32 años.

El equipo utilizó un etiquetado masivo en tándem (TMT, por su sigla en inglés) de 10 plex y dividió cada muestra en seis fracciones; cada una de ellas fue procesada en un gradiente de nanoLC de 100 minutos antes del análisis en un instrumento Q-Exact Plus (Thermo Fisher Scientific, Waltham , MA, EUA). Para el análisis de fosfopéptidos, usaron el enriquecimiento mediante Cromatografía de Afinidad de Metal Inmovilizado (IMAC). Encontraron que las 60 muestras proporcionaron suficiente material para el análisis de expresión proteica de todo el proteoma y 18 de las 60 muestras proporcionaron suficiente material para el trabajo de fosfopéptidos.

Los investigadores identificaron y cuantificaron un total de 8.582 proteínas y 8.073 fosfopéptidos en todo el conjunto de muestras SEER, lo que indica que el tejido FFPE es susceptible de análisis proteómico mediante espectrometría de masas. Se redujeron las identificaciones de proteínas en comparación con las identificaciones posibles en muestras incrustadas de compuestos de temperatura óptima de corte (OCT). En comparación con las muestras de OCT, las identificaciones de péptidos, proteínas y fosfopéptidos se redujeron en un 50%, 20% y 76%, respectivamente.

Karin D, Rodland, PhD, experta en espectrometría de masas y autora principal del estudio, dijo: “Ha habido kits comerciales disponibles durante 12 a 15 años para extraer proteínas de bloques FFPE y en vista de ello, los rendimientos de proteína cuando se usan los bloques de FFPE no son tan malos. Pero con las tecnologías de espectrometría de masas de hace 12 a 15 años, la tasa de identificación era muy baja. Simplemente no se obtenía una buena cobertura [proteoma] usando los bloques FFPE. Y la suposición era que la reticulación con formalina causaba la pérdida de identificaciones. Sin embargo, las mejoras en la tecnología en la espectrometría de masas han proporcionado instrumentos con mayor sensibilidad y mejor resolución que son capaces de trabajar con cantidades más pequeñas de muestra”. El estudio fue publicado el 3 de agosto de 2018 en la revista Clinical Proteomics.

Enlace relacionado:
Laboratorio Nacional del Noroeste del Pacífico
Thermo Fisher Scientific



Print article

Canales

Química Clínica

ver canal
Imagen: Xantomas tendinosos en la mano de un paciente con hipercolesterolemia familiar (Fotografía cortesía de ScreenPro FH).

Examen de las donaciones de sangre para detectar hipercolesterolemia familiar

La hipercolesterolemia familiar es un trastorno autosómico dominante que, a menudo, causa una enfermedad coronaria prematura. Desafortunadamente, la hipercolesterolemia familiar permanece en gran parte... Más

Diagnóstico Molecular

ver canal
Imagen: Una histopatología del carcinoma colorrectal: un ejemplo de adenocarcinoma moderadamente diferenciado que muestra estructuras glandulares complicadas en un estroma desmoplásico (Fotografía cortesía de la Facultad de Medicina David Geffen de la Universidad de California).

ctADN pronostica la recurrencia del cáncer colorrectal no metastásico

El cáncer colorrectal (CCR), también conocido como cáncer intestinal y cáncer de colon, es el desarrollo de cáncer en el colon o el recto (partes del intestino grueso). La mayoría de los cánceres colorrectales... Más

Hematología

ver canal
Imagen: El kit Indicador de Sepsis Temprana diseñado para ser usado en instrumentos de hematología automatizados, como el analizador DxH 900 (Fotografía cortesía de Beckman Coulter).

Aprueban para comercialización en los Estados Unidos una prueba para la detección temprana de la sepsis

Una prueba para la detección temprana de sepsis ha sido aprobada para su comercialización en los Estados Unidos como un producto de diagnóstico in vitro. La sepsis es causada por una respuesta inmune... Más

Inmunología

ver canal
Imagen: La punta de pipeta única creada con una impresora 3D para realizar ensayos inmunoabsorbentes ligados a enzimas (Fotografía cortesía de la Universidad de Connecticut).

Tecnología novedosa impresa en 3D disminuye los costos de las pruebas ELISA

Las pruebas tradicionales de ensayos inmunoabsorbentes ligados a enzimas (ELISA) se realizan en placas con 96 micropozos; cada pozo funciona como una cámara de análisis separada donde las muestras se pueden... Más

Microbiología

ver canal
Imagen: El kit Nextera XT Index se usa para preparar bibliotecas de secuenciación del genoma completo para aislamientos bacterianos (Fotografía cortesía del Dr. Thippeswamy Sannasiddappa).

Microbioma de las vías aéreas se altera en el asma severa asociado a los neutrófilos

Los pacientes con asma leve a moderada pueden experimentar dificultad para respirar y es especialmente difícil para las personas con asma grave, donde los síntomas pueden ser potencialmente mortales.... Más

Patología

ver canal
Imagen: Un ganglio linfático con reemplazo casi completo por un melanoma metastásico. El pigmento marrón es el depósito focal de la melanina (Fotografía cortesía de Gabriel Caponetti, MD).

Prueba en sangre mide la efectividad de los tratamientos agresivos para el cáncer

Los análisis de sangre que rastrean la cantidad de ADN tumoral pueden, después de solo un mes de terapia con medicamentos, detectar qué tan bien funciona el tratamiento en pacientes con cáncer de piel.... Más

Industria

ver canal
Imagen: La solución de automatización total de laboratorios DxA (Fotografía cortesía de Beckman Coulter).

Beckman Coulter presenta una nueva solución de automatización total de laboratorios

La última incorporación de Beckman Coulter (Brea, CA, EUA) a su cartera de automatización, la solución de automatización total de laboratorios, DxA 5000, ha logrado la aprobación de la Marca CE Europea... Más
Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.