Señales epigenéticas en sangre mejoran el monitoreo del osteosarcoma

La vigilancia mediante técnicas de imagen puede pasar por alto lesiones pequeñas y somete a los niños a exploraciones repetidas, mientras que las biopsias líquidas convencionales suelen tener dificultades debido a que los tumores liberan poco ADN tumoral circulante (ADNtc).

Por lo tanto, los médicos se enfrentan a opciones limitadas para el seguimiento mínimamente invasivo de la enfermedad. Nuevos hallazgos demuestran que las señales epigenéticas en el ADN derivado de la sangre pueden correlacionarse con el estado de la enfermedad en el osteosarcoma.

Investigadores de University of Chicago Medicine y sus colaboradores identificaron patrones epigenéticos en fragmentos de ADN circulante que se correlacionan con el estado de la enfermedad en pacientes con osteosarcoma. El trabajo, publicado en npj Precision Oncology, apunta a un posible enfoque basado en análisis de sangre para el seguimiento de la enfermedad. Los investigadores se centraron en las modificaciones químicas del ADN que regulan la actividad génica, en lugar de la detección de mutaciones únicamente.

El método, denominado nano-hmC-seal, marca químicamente fragmentos de ADN que contienen 5-hidroximetilcitosina (5-hmC) para permitir el mapeo genómico de la actividad génica a partir de ADN libre circulante (ADNlc). Al analizar patrones epigenéticos en lugar de depender únicamente del ADNtc, que suele ser escaso en el osteosarcoma, esta estrategia proporciona información similar a la secuenciación de ARN, pero utilizando ADN plasmático en lugar de biopsias de tejido. Este marco busca capturar la actividad transcripcional asociada a la enfermedad mediante una extracción de sangre mínimamente invasiva.

En muestras de sangre de pacientes, el equipo confirmó niveles bajos de ADNtc, pero observó diferencias detectables en los perfiles de 5-hmC entre los distintos estados de la enfermedad. Definieron una firma genética de 136 genes con niveles elevados de 5-hmC en pacientes en comparación con individuos sanos, muchos de los cuales están relacionados con la biología y el recambio óseo. Esta señal apareció en pacientes con tumores óseos primarios y metástasis óseas, pero estuvo prácticamente ausente cuando las metástasis se limitaban a los pulmones o los ganglios linfáticos, lo que probablemente refleja una menor liberación de ADN por parte de lesiones pequeñas.

El estudio fue relativamente pequeño y se diseñó principalmente para evaluar la viabilidad. Según los autores, se necesitan estudios más amplios para confirmar estos hallazgos, evaluar si el perfilado de 5-hmC del ADN libre circulante puede complementar los enfoques existentes para la detección del ADN tumoral y determinar su potencial para orientar las decisiones de tratamiento o identificar la recaída de forma más temprana.

“Las tecnologías de biopsia líquida han transformado la atención oncológica en muchos tipos de cáncer en los últimos años, pero trasladar estos avances a cánceres raros como el osteosarcoma sigue siendo un desafío importante”, dijo el primer autor, Evan Neczypor, MD, residente de Medicina Interna en UChicago Medicine.

“Logramos encontrar diferencias en los patrones de hidroximetilcitosina en el ADNlc entre pacientes con diferentes estadios de la enfermedad”, afirmó Mark Applebaum, MD, profesor asociado de Pediatría en UChicago Medicine y autor principal del estudio. “Si podemos combinar este enfoque con otras técnicas para analizar el ADN circulante, se podrían abrir nuevas oportunidades para monitorizar a los pacientes y comprender mejor cómo evoluciona su enfermedad con el tiempo”.

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UChicago Medicine