Recomiendan análisis genómico clínico para pacientes con sarcoma óseo

La falta de terapias dirigidas efectivas para la mayoría de los sarcomas puede abordarse en parte aumentando el conocimiento limitado disponible del panorama mutacional de los tumores mesenquimatosos, que están mucho menos estudiados, en comparación con los cánceres epiteliales y de origen neural.

Un gran equipo de científicos clínicos dirigido por los del Centro de Cáncer Memorial Sloan Kettering (MSKCC, Nueva York, NY, EUA), examinó retrospectivamente los perfiles genómicos de especímenes de sarcoma clínico analizados por Foundation Medicine (Cambridge, MA, EUA), durante el período de 2012 a 2018. El equipo realizó la secuenciación de próxima generación utilizando la plataforma FoundationOne Heme de Foundation Medicine en casi 7.500 pacientes adultos y pediátricos con sarcoma que representaban 44 subtipos de sarcoma.

Los investigadores informaron que alrededor de un tercio (31,7 %) de los pacientes con sarcoma en su estudio albergaban al menos una mutación potencialmente procesable, incluida una proporción significativa (2,6 %) con reordenamientos del gen de la quinasa; el 3,9 % tiene una carga mutacional tumoral ≥10 mut/Mb. La mayoría de estos biomarcadores tenían un estado de nivel 3 en el OncoKB de MSK, lo que indica que había evidencia de que pueden predecir si los pacientes con cánceres distintos de los sarcomas se podrían beneficiar con ciertos medicamentos.

En todos los sarcomas, casi la mitad de los pacientes tenían alteraciones en la vía p53, que regula la estabilidad genómica, y el 47,8 % presentaba alteraciones en TP53, MDM2 y MDM4. Cerca de la mitad de los pacientes, el 46,8 %, también presentaba alteraciones en la vía Rb que regula el ciclo celular e incluye alteraciones en RB1, CDKN2A/B, CDK4/6, CCND1/2/3 y CCNE1. Hubo frecuencias bajas de inestabilidad de microsatélites (<0,3 %) y un alto grado de pérdida de heterocigosidad en todo el genoma (15 %) en los sarcomas, que no se explica fácilmente por la deficiencia de recombinación homóloga (observada en el 2,5 % de los casos). En un subconjunto clínicamente anotado de 118 pacientes, validaron eventos genéticos procesables como objetivos terapéuticos.

Mrinal M. Gounder, MD, oncólogo médico y autor principal del estudio, dijo: “Hay algunas enfermedades en las que, por ejemplo, la carga de mutaciones tumorales es extremadamente baja, pero incluso en esa enfermedad hay valores atípicos. Si solo se mirara la histología y no se mirara la genómica, se habrían pasado por alto. Si realizó la secuenciación genómica y, por cierto, encontró a este paciente, tal vez sea solo un paciente de 50 pacientes, pero si puede cambiar esa vida con un medicamento que ya está disponible, vale la pena hacer una prueba como esta”.

Los autores concluyeron que sus hallazgos sugieren una utilidad clínica creciente para la secuenciación genómica, especialmente para el tratamiento de cánceres raros como los sarcomas. A la luz de las posibles limitaciones de costos y recursos, se debe desarrollar un marco para el uso juicioso de las pruebas de NGS para los sarcomas. El estudio fue publicado el 15 de junio de 2022 en la revista Nature Communications.

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Foundation Medicine
OncoKB