Herramienta de diagnóstico viral avanzada se acerca al uso generalizado

Las herramientas de diagnóstico clínico actuales se centran principalmente en identificar patógenos específicos y conocidos. Estos ensayos dirigidos, como las pruebas de PCR y de antígenos ampliamente utilizadas durante crisis sanitarias como la pandemia de COVID-19, son cruciales para el diagnóstico. Sin embargo, son intrínsecamente reactivos y normalmente entran en juego una vez que ya está en marcha un brote. La secuenciación de próxima generación (NGS) proporciona una gama más amplia de detección de patógenos, pero carece de la sensibilidad de los ensayos específicos. Para superar esto, en 2015 se lanzó un sistema avanzado de detección y vigilancia basado en NGS llamado VirCapSeq-VERT. Este sistema es capaz de detectar cualquier virus que pueda infectar a los humanos, ya sea previamente identificado o no, con mayor sensibilidad y velocidad en comparación con otras plataformas de NGS. La última versión de VirCapSeq ha sido validada y publicada en el Journal of Clinical Microbiology .

Desarrollado por científicos del Centro de Infección e Inmunidad (CII) de la Escuela de Salud Pública Mailman de la Universidad de Columbia (Nueva York, NY, EUA), VirCapSeq se ha utilizado a nivel mundial en investigaciones para estudiar brotes de enfermedades agudas y crónicas y realizar vigilancia en humanos. animales domésticos y vida silvestre. Recientemente, el CII colaboró con la Autoridad de Investigación y Desarrollo Biomédico Avanzado (BARDA) para acelerar el desarrollo de la plataforma como herramienta de diagnóstico viral, con el objetivo de fortalecer la preparación de Estados Unidos para futuros brotes y mejorar las capacidades en el diagnóstico de enfermedades infecciosas. En 2022, la tecnología recibió la aprobación del estado de Nueva York para usarse en la detección de ácidos nucleicos de virus de ADN y ARN en plasma, y al año siguiente, la aprobación se amplió a los hisopos nasales para diagnosticar infecciones sistémicas y respiratorias. Los investigadores del CII esperan que la tecnología se utilice pronto de forma rutinaria en los hospitales.

El estudio de validación, parte de la solicitud regulatoria de CII al estado de Nueva York, se centró en evaluar la sensibilidad, consistencia y repetibilidad de la detección de VirCapSec. El estudio también evaluó su capacidad para identificar varios virus en coinfecciones y examinó su exactitud y precisión en condiciones clínicas del mundo real. Los resultados fueron impresionantes: VirCapSeq-VERT logró una sensibilidad clínica del 99 % y una especificidad clínica del 100 %. Además, identificó coinfecciones con virus clínicamente significativos que no fueron detectados por los ensayos comparadores estándar utilizados para las pruebas de diagnóstico iniciales.

"VirCapSeq es la única tecnología de secuenciación con aprobaciones regulatorias que tiene una amplia cobertura de secuenciación imparcial de alto rendimiento con una sensibilidad significativamente mayor en la detección e identificación de todos los virus de vertebrados, incluidas las especies nuevas y emergentes", dijo Vishal Kapoor, MS, subdirector para medicina de laboratorio en el CII. "Esta tecnología puede ayudar a identificar nuevas amenazas virales en las primeras etapas de una emergencia de salud pública con el potencial de contener brotes y prevenir pandemias".

"Nuestra tecnología está preparada para transformar la medicina de precisión, brindando a los cuidadores la capacidad de identificar rápidamente la causa de una infección para guiar el tratamiento", agregó W. Ian Lipkin, MD, profesor de epidemiología John Snow y director del CII. "Al mismo tiempo, esta herramienta de diagnóstico será de gran ayuda para la salud pública al proporcionar información sobre los virus que circulan en una comunidad".

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