La secuenciación rápida podría transformar la atención de la tuberculosis

La tuberculosis sigue siendo la principal causa de muerte en el mundo provocada por un solo agente infeccioso, responsable de más de un millón de fallecimientos cada año. El diagnóstico y el seguimiento de la enfermedad pueden ser lentos porque las pruebas de laboratorio suelen requerir cultivar la bacteria durante varias semanas antes de iniciar el análisis genético. Estos retrasos limitan la capacidad de los médicos y de los equipos de salud pública para identificar rápidamente la resistencia a los fármacos y orientar las decisiones terapéuticas.

Ahora, investigadores han adaptado una técnica de secuenciación utilizada originalmente durante la pandemia de COVID-19 para analizar muestras de tuberculosis mucho más rápidamente.

Científicos de la Escuela de Salud Pública de Yale (YSPH; New Haven, Connecticut, EE. UU.) adaptaron la secuenciación por amplicones en mosaico, un método ampliamente utilizado durante la pandemia de COVID-19 para monitorear variantes virales emergentes. Este enfoque emplea miles de pequeños fragmentos de ADN llamados amplicones para copiar segmentos superpuestos del genoma de un patógeno. Al combinarse, estos fragmentos permiten reconstruir la secuencia genética completa.

A diferencia de los métodos tradicionales, la técnica permite a los investigadores secuenciar el genoma de Mycobacterium tuberculosis directamente a partir de muestras de pacientes, sin necesidad de cultivar previamente la bacteria.

Los investigadores diseñaron un protocolo con 5.128 cebadores para capturar el genoma completo de la tuberculosis, que es más de 100 veces mayor que el de SARS-CoV-2. Utilizando muestras de pacientes de Moldavia y Perú, el método logró reconstruir genomas bacterianos completos en cuestión de días, incluso cuando las concentraciones de bacterias eran bajas o cuando estaban presentes otros microorganismos.

El estudio, publicado en Journal of Clinical Microbiology, mostró que este enfoque puede reducir el tiempo de secuenciación de varias semanas a solo unos días, además de disminuir los costos de cientos de dólares por muestra a menos de 20 USD.

El método de secuenciación más rápido y de menor costo podría mejorar la vigilancia de la tuberculosis y la toma de decisiones terapéuticas, especialmente en países de ingresos bajos y medios, donde la carga de la enfermedad es mayor. El análisis rápido del genoma puede ayudar a los médicos a detectar antes cepas resistentes a los fármacos y apoyar los esfuerzos de salud pública para seguir los patrones de transmisión.

Los investigadores están trabajando ahora con socios en Moldavia para probar el método en entornos clínicos reales. Los estudios futuros compararán el nuevo protocolo con la secuenciación tradicional basada en cultivo y evaluarán su impacto más amplio en la atención de la tuberculosis y el control global de la enfermedad.

“Podemos secuenciar de forma brillante en New Haven. Podemos secuenciar de forma brillante en Londres. Podemos secuenciar en los lugares donde disponemos de todos los recursos, pero la tuberculosis farmacorresistente se encuentra en otros lugares”, afirmó el Dr. Seth Redmond, licenciado, máster y doctor, investigador asociado de YSPH y autor principal del estudio. “Está en Sudáfrica. Está en Moldavia. Está en la India. En estos lugares es donde debemos asegurarnos de que esto funcione”.

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