Prueba en heces predice rápidamente la resistencia a los antibióticos de H. pylori

Las tasas de erradicación de Helicobacter pylori han disminuido junto con el aumento de la resistencia a los antimicrobianos en todo el mundo. Es necesario realizar pruebas de resistencia a los antibióticos rápidas, exactas y fiables, especialmente en los casos refractarios.

Las pruebas de sensibilidad basadas en cultivos requieren una biopsia gástrica endoscópica, con los consiguientes inconvenientes y costos. Las pruebas moleculares que utilizan la secuenciación de siguiente generación (NGS) de las heces permiten, potencialmente, una rápida predicción de la resistencia a los seis antimicrobianos de uso común.

Los científicos clínicos del Hospital de Rhode Island (Providence, RI, EUA) y sus colegas, compararon la exactitud de la NGS con la biopsia gástrica para identificar la resistencia a los antibióticos de H. pylori en 262 pacientes programados para endoscopia superior en cuatro consultorios clínicos. Se tomaron dos biopsias gástricas para NGS y también se obtuvo una muestra de heces expulsados espontáneamente dentro de las dos semanas posteriores a la endoscopia, pero antes de comenzar el tratamiento para H. pylori. H. pylori se confirmó en biopsias mediante PCR seguida de NGS. H. pylori en heces se confirmó mediante prueba de antígeno fecal y PCR. Las muestras de heces positivas, en al menos dos pruebas de heces, también fueron examinadas por NGS para predecir la resistencia a amoxicilina, claritromicina, metronidazol, tetraciclina, levofloxacina y rifabutina.

Los investigadores informaron que 73 (29%) pacientes fueron H. pylori positivos en las pruebas de heces; dos tenían ADN gástrico insuficiente para el análisis. De los 71 casos evaluables, se obtuvieron resultados idénticos para las muestras de heces y biopsias para los seis antibióticos en 65 (91,5%). En seis casos hubo desajuste entre los resultados gástricos y de las heces; en cuatro casos, esto se debió a una diferencia de mutación asociada al antibiótico. Para el 70,4% de las biopsias gástricas, hubo al menos una mutación asociada a la resistencia. Solo 21 (29,6%) no tenían mutaciones. Los resultados para las heces fueron similares: 50 casos (68,5%) tenían al menos una mutación asociada a resistencia y 23 (31,5%) no tenían mutaciones. La concordancia entre las heces y las biopsias gástricas para los antibióticos individuales osciló entre el 89% (metronidazol) y el 100%.

Steven Moss, MD, gastroenterólogo y autor principal del estudio, dijo: “Las pruebas de susceptibilidad basadas en cultivos requieren una biopsia gástrica endoscópica, con los consiguientes inconvenientes y costos. Ahora es posible obtener rápidamente datos de susceptibilidad sin necesidad de endoscopia”.

Los autores concluyeron que la determinación del perfil de la resistencia a los antibióticos de H. pylori mediante NGS, a partir de muestras de heces, proporciona resultados rápidos muy comparables a los obtenidos a partir de biopsias gástricas. El uso de NGS para determinar la resistencia a los antibióticos de H. pylori utilizando heces evita el costo, las molestias y los riesgos de la endoscopia para los pacientes en los que se necesita un perfil de resistencia. El estudio fue presentado en el Congreso Virtual 2021 del Colegio Americano de Gastroenterología (ACG), que se llevó a cabo del 22 al 27 de octubre de 2021.

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Hospital de Rhode Island