Conjunto de iniciadores de HLA logran genotipificación con resolución alta y media

Unos nuevos conjuntos de iniciadores para Antígenos Leucocitarios Humanos (HLA) logran una genotipificación con resolución alta a media de los loci de la clase I y II de los genes de los HLA.

Introducido por 454 Life Sciences (Brandford, Connecticut, EUA), una compañía Roche, los nuevo Conjuntos de Iniciadores GS GType New HLA están diseñados para uso con los sistemas de secuenciación de mesa GS Junior y de próxima generación GS FLX, que permiten la tipificación de alta resolución y la asignación inequívoca de alelos en una sola corrida.

Los kits son los primeros de una serie de análisis en las áreas de inmunogenética, enfermedades infecciosas y cáncer que serán presentados para uso con los Sistemas de Secuenciación 454 (454 Sequencing Systems), permitiendo a los científicos integrar fácilmente los flujos de trabajo del laboratorio específicos para la aplicación.

Los genes HLA codifican las proteínas del sistema inmune que reconocen las células extrañas y otros antígenos. La caracterización exacta del tipo de HLA de un individuo es importante para la compatibilidad del trasplante de tejidos, mientras que las variaciones en estos genes se han asociado con una amplia variedad de enfermedades autoinmunes, enfermedades infecciosas y algunos tipos de cáncer.

Las lecturas largas, clonales proporcionadas por 454 Sequencing Systems permitirán una resolución alta directa de múltiples muestras a la vez. En muchos casos la tipificación del HLA logra la identificación inequívoca de alelos en un solo ensayo de secuenciación. La secuencia de salida es compatible con los software de genotipificación de HLA, de terceros, - que les ofrecen a los científicos una solución completa para la asignación del ADN al genotipo.

La genotipificación de los genes HLA puede ser un reto debido a la naturaleza altamente polimórfica de esta región del genoma humano. La tipificación tradicional basada en la secuencia utilizando la tecnología de electroforesis capilar de Sanger es incapaz de resolver las ambigüedades y establecer la fase, sin necesidad de iteraciones múltiples, intercaladas con el análisis manual de los datos importantes, y a menudo usan múltiples tecnologías.

Los Conjuntos de Iniciadores SG GType HLA son el resultado de un amplio estudio multicéntrico, que fue publicado en marzo de 2011, en la revista Tissue Antigens.

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454 Life Sciences