Secuenciación de ADN libre de células confirma diagnóstico del síndrome mielodisplásico

El uso de métodos de secuenciación de próxima generación (NGS) para analizar el ADN libre de células (cf-ADN), en la sangre de pacientes con síndrome mielodisplásico (MDS), produce resultados más exactos que el método estándar actual de secuenciación de Sanger.

 

Los síndromes mielodisplásicos (MDS) son un grupo heterogéneo de trastornos, que se caracterizan por la presencia de células neoplásicas clonales en la médula ósea que dan origen a hematopoyesis ineficaz y citopenias en la sangre periférica (SP). Los principales criterios para el diagnóstico de los MDS son la presencia de citopenia periférica y displasia.

 

Los científicos de los Laboratorios NeoGenomics (Irvine, CA, EUA) recogieron muestras de sangre periférica de 16 pacientes confirmados de tener MDS a través de la evaluación de la médula ósea y de cuatro controles normales de la misma edad. Todos los pacientes tenían menos de 5% de blastos Esto incluyó a pacientes con citopenia refractaria con displasia unilinaje, citopenia refractaria con displasia multilinaje y anemia refractaria con sideroblastos en anillo (ARSA). El equipo extrajo el cf-ADN del plasma y el ADN celular a partir de las células de SP.

 

El ácido nucleico total fue aislado a partir de plasma usando la plataforma automatizada NucliSENS easyMAG (BioMérieux, Marcy-l'Étoile, Francia). El ADN fue cuantificado, a continuación usando un fluorómetro Qubit 2.0 (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, EUA). La secuenciación NGS y de Sanger fueron realizadas para varios genes específicos. Los productos de la reacción en cadena de polimerasa fueron purificados y secuenciados en ambas direcciones: hacia adelante y hacia atrás utilizando un Analizador Genético ABI PRISM 3730XL (Applied Biosystems, Foster City, CA, EUA). 

 

Tras la secuenciación profunda del cf-ADN del plasma, los 16 pacientes mostraron al menos un gen mutado, lo que confirma la presencia de un clon anormal consistente con el MDS. No se detectó anormalidad en ninguna de las cuatro muestras de los individuos normales que sirvieron de control. Ocho pacientes (50%) presentaron mutación en un gen y los ocho pacientes restantes (50%) mostraron mutaciones en dos o más genes. Cinco de los 16 pacientes (31%) mostraron mutaciones detectadas por NGS del cf-ADN, mientras que la secuenciación Sanger del ADN celular en la SP no mostró evidencia de mutación.

 

Garth D. Ehrlich, PhD, FAAAS, Editor en Jefe de la revista donde se publicó el estudio, dijo: “Este es un hallazgo notable en el sentido de que el ADN libre de células proporciona un ensayo más sensible para la detección de cáncer que el método tradicional de analizar el ADN asociado a las células”. El estudio fue publicado el 14 de julio de 2016, en la revista Genetic Testing and Molecular Biomarkers.

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