Consorcio de investigación aprovecha IA y biología espacial para adelantar descubrimiento del cáncer

La IA tiene el potencial de transformar la atención oncológica; sin embargo, el progreso sigue limitado por datos fragmentados e inaccesibles que dificultan los avances en el diagnóstico temprano y la terapia de precisión. Descubrir patrones que los métodos convencionales no detectan requiere grandes conjuntos de datos bien anotados que integren datos moleculares, de imagen y espaciales. Para cerrar esta brecha, una nueva colaboración busca crear uno de los conjuntos de datos multimodales sobre cáncer más completos del mundo, combinando la elaboración de perfiles espaciales con inteligencia artificial (IA).

PharosAI, un consorcio de investigación que reúne al King's College de Londres, la Universidad Queen Mary de Londres, Guy's and St Thomas' NHS Foundation Trust y Barts Health NHS Trust, implementará la plataforma espacial Xenium de 10x Genomics para crear conjuntos de datos de cáncer compatibles con IA y un conjunto integrado de herramientas analíticas. La iniciativa se centrará inicialmente en el cáncer de mama antes de expandirse a los cánceres de pulmón y páncreas, con planes para incorporar miles de muestras de tejido clínicamente anotadas.

El programa convertirá décadas de muestras de cáncer archivadas del NHS en conjuntos de datos de alta resolución con resolución espacial, a la vez que vinculará datos genómicos, transcriptómicos, de imagen y de biología espacial con modelos de IA personalizados. Xenium fue seleccionado para ofrecer resultados reproducibles en miles de tejidos de archivo, con la ayuda de un flujo de trabajo de alto rendimiento y la capacidad de generar paneles genéticos personalizados en colaboración con los equipos de 10x Genomics. Estas capacidades permitirán ensayos alineados con las características moleculares más relevantes para cánceres específicos.

Con un respaldo de 18,9 millones de libras del programa Research Ventures Catalyst del Gobierno del Reino Unido, y apoyo adicional de organizaciones benéficas y socios del sector, PharosAI recopilará conjuntos de datos a gran escala, modelos computacionales y herramientas analíticas para acelerar el diagnóstico precoz, facilitar terapias de precisión y acelerar el descubrimiento de nuevos tratamientos. El consorcio pondrá los conjuntos de datos a disposición de una amplia comunidad de investigadores e innovadores de forma segura, y el programa estará vigente hasta 2027.

“Para que el conocimiento biológico tenga impacto, es necesario generar datos consistentes y de alta calidad a gran escala”, afirmó Serge Saxonov, director ejecutivo y cofundador de 10x Genomics. “Con Xenium, PharosAI puede convertir décadas de muestras de cáncer archivadas del NHS en conjuntos de datos robustos, de alta calidad y con resolución espacial. Esta base permite avanzar con mayor rapidez, precisión y confianza hacia la próxima generación de avances en la investigación del cáncer”.

Enlaces relacionados
10x Genomics, Inc.
PharosAI

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