Novedosa metodología traduce ADN no-codificante en cáncer colorrectal

Los genetistas de la Universidad de Ginebra (Suiza) utilizaron la tecnología de secuenciación del genoma para comparar el ácido ribonucleico (ARN) entre el tejido sano y el tejido tumoral de 103 pacientes. Ellos buscaron elementos reguladores presentes en la porción grande, no-codificante del genoma, que afectan el desarrollo del cáncer colorrectal. El objetivo fue identificar el efecto, presente sólo en el tejido canceroso, de mutaciones adquiridas cuya activación habría provocado la enfermedad y es el primer estudio de esta escala en examinar el genoma no codificante de los pacientes con cáncer. Se evaluó la calidad del ARN utilizando el Kit Bioanalyzer ARN 6000 Nano (Agilent Technologies, Santa Clara, CA, EUA) y la cantidad de ARN fue medida con el fluorómetro Qubit 2.0, utilizando el kit de gama Amplia ARN (Invitrogen, Carlsbad, CA , EUA) y la secuenciación del ARN mensajero (ARNm) se realizó en una plataforma HiSeq 2000 (Illumina; San Diego, CA, EUA).

El equipo fue capaz de identificar dos tipos de mutaciones no codificantes que tienen un impacto en el desarrollo del cáncer colorrectal. Ellos encontraron, por un lado, las variantes hereditarias reguladoras que no están activas en el tejido sano, pero que se activan en los tumores y parecen contribuir a la progresión del cáncer. Esto demuestra que el genoma heredado no sólo afecta a la predisposición a desarrollar cáncer, sino que también tiene una influencia en su progresión. Por otro lado, los científicos identificaron efectos de las mutaciones adquiridas en la regulación de la expresión de los genes que afectan a la génesis y progresión de los tumores colorrectales.

Halit Ongen, PhD, autor principal del estudio, dijo: “Los elementos responsables para el desarrollo y la progresión de los cánceres localizados en el genoma no codificante, son tan importantes como las que se encuentran en las regiones codificantes del genoma. Por lo tanto, el análisis de los factores genéticos en todo nuestro genoma, y no sólo en las regiones codificantes como se hacía antes, nos da una visión más completa de las causas genéticas del cáncer colorrectal”. El estudio fue publicado el 23 de julio de 2014, en la revista Nature.

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