Plataforma de PCR adaptativa mejora la consistencia en flujos de trabajo de NGS de lotes pequeños

La amplificación por PCR durante la preparación de bibliotecas para secuenciación de nueva generación (NGS) puede introducir variabilidad, lo que a menudo requiere cuantificación manual y conlleva el riesgo de artefactos por sobreciclado. Este problema es especialmente importante para lotes pequeños o muestras con baja cantidad de material de partida, donde las bibliotecas fallidas pueden ser irrecuperables. Un sistema recientemente lanzado extiende el control adaptativo de la amplificación por pocillo a flujos de trabajo de NGS de menor rendimiento sin añadir pasos de limpieza ni modificar los flujos de trabajo.

n6 (Pleasanton, CA, EE. UU.) ha presentado icon16, ampliando su amplificación adaptativa AutoNorm a un formato de 16 pocillos para laboratorios que realizan NGS de bajo rendimiento. La compañía lanzó previamente icon96 en 2024, que ahora se utiliza en más de 22 países, incluyendo el Broad Institute y el Wellcome Sanger Institute. Según la compañía, la plataforma admite la investigación genómica, las aplicaciones clínicas y las modalidades de secuenciación emergentes, manteniendo los estándares de calidad de datos para el procesamiento de lotes pequeños.

AutoNorm reemplaza la PCR de ciclo fijo con monitorización de fluorescencia en tiempo real a nivel de pocillo individual. En lugar de someter todas las muestras a un número predeterminado de ciclos, el instrumento detiene cada pocillo de forma independiente en un umbral de amplificación definido por el usuario. Este enfoque genera bibliotecas "normalizadas biológicamente", con el objetivo de evitar artefactos por sobreciclado y pérdida de datos, eliminando la cuantificación y limpieza manuales previas a la agrupación. El método se presenta como independiente del secuenciador y de la aplicación, y se integra con los flujos de trabajo de preparación de bibliotecas existentes.

El sistema icon16 está diseñado para la secuenciación de ARN de células individuales, transcriptómica espacial, análisis de ADN libre circulante (cfDNA) y enfermedad residual mínima (MRD), secuenciación de enfermedades raras y otros flujos de trabajo de lotes pequeños. El instrumento es compatible con diversos reactivos y con los principales kits comerciales de preparación de bibliotecas, sin necesidad de modificar los protocolos NGS ya establecidos. El sistema estará disponible para su compra a partir del 30 de marzo de 2026, y se prevé que los primeros envíos se realicen poco después.

"La tecnología de secuenciación ha avanzado rápidamente, pero el termociclador, elemento central en la preparación de bibliotecas, apenas ha cambiado en décadas", afirmó Pranav Patel, doctor en filosofía y máster en administración de empresas, cofundador y director ejecutivo de n6. "Con icon96, presentamos AutoNorm para reemplazar el enfoque estandarizado de amplificación. icon16 ofrece esa misma capacidad a los laboratorios que procesan lotes de secuenciación más pequeños, manteniendo el mismo estándar de calidad de datos".

'No existen muchas tecnologías que, desde el principio, puedan impactar significativamente los flujos de trabajo establecidos", afirmó James Docker, responsable de NGS y científico multiómico del Centro de Genética Humana de la Universidad de Oxford. "Pero con la tecnología AutoNorm, podemos cambiar radicalmente la forma en que se aborda la PCR en la preparación de bibliotecas".

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