Análisis del ARN revela dianas terapéuticas en tumores sólidos

Se está explorando la ampliación del perfil molecular más allá del ADN para descubrir oportunidades terapéuticas adicionales.

Un nuevo estudio prospectivo informa que el perfilado integral del transcriptoma de ARN puede descubrir múltiples dianas para conjugados anticuerpo-fármaco en tumores sólidos avanzados que carecen de opciones basadas en ADN.

El perfilado de exoma completo y transcriptoma de BostonGene, combinado con un análisis multiómico impulsado por inteligencia artificial (IA), fue evaluado en el estudio FEASY, realizado en colaboración con el Centro Oncológico MD Anderson de la Universidad de Texas. Los hallazgos, publicados en Cancer Discovery, analizaron la utilidad clínica del perfilado integral del transcriptoma en pacientes con tumores sólidos avanzados. El trabajo se centró en identificar dianas terapéuticas que no se detectaban mediante pruebas basadas únicamente en ADN.

El enfoque integra el análisis integral del transcriptoma con un análisis inmunológico integrado para modelar la biología tumoral mientras filtra hallazgos no esenciales. Al combinar el perfilado de exoma completo y transcriptoma con inteligencia artificial, el método interpreta señales complejas de ARN y las traduce en dianas y vías biológicas relevantes. Este marco está diseñado para vincular los hallazgos moleculares con clases terapéuticas específicas.

En la cohorte prospectiva, los pacientes se habían sometido previamente a pruebas de panel de ADN de más de 100 genes, pero no presentaban biomarcadores recomendados por la Administración de Alimentos y Medicamentos de Estados Unidos (FDA) ni por la Red Nacional Integral del Cáncer (NCCN) para opciones terapéuticas. El análisis multiómico basado en ARN identificó hallazgos de ARN relevantes para la toma de decisiones clínicas en todos los pacientes analizados. Los conjugados anticuerpo-fármaco (ADC) surgieron como la clase terapéutica más frecuente asociada con estos hallazgos de ARN derivados de la IA, y cada paciente presentaba múltiples dianas distintas vinculadas a los ADC.

El estudio indica que la elaboración de perfiles mediante transcriptoma puede brindar nuevas oportunidades para la inscripción en ensayos clínicos, particularmente en programas centrados en conjugados anticuerpo-fármaco (ADC), y ayudar a identificar oportunidades terapéuticas para pacientes que anteriormente no tenían resultados útiles en las pruebas de ADN únicamente.

"El perfilado multiómico y el análisis biológicamente integrado están transformando el panorama del tratamiento para pacientes con los cánceres más avanzados", afirmó el Dr. Nathan Fowler, director médico de BostonGene.

"Al combinar plataformas avanzadas de IA con nuestras pruebas moleculares multicapa, descubrimos oportunidades terapéuticas que las pruebas genómicas estándar suelen pasar por alto. Estos hallazgos conectan directamente a más pacientes con terapias que cambian la vida, como los conjugados anticuerpo-fármaco (ADC), y aceleran el desarrollo de la próxima generación de tratamientos dirigidos," dijo el Dr. Fowler.

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