Las interacciones genéticas huésped-virus impulsan el riesgo de cáncer nasofaríngeo

El virus de Epstein-Barr (VEB) infecta a más del 95 % de los adultos en todo el mundo, pero solo una pequeña fracción desarrolla cánceres asociados al VEB, como el carcinoma nasofaríngeo. Para explicar esta diferencia, es necesario comprender cómo los factores humanos y virales influyen conjuntamente en el riesgo de padecer la enfermedad. Sin embargo, los estudios suelen analizar los genomas del huésped o del patógeno de forma aislada. Un nuevo estudio demuestra que las interacciones específicas entre los genomas humanos y virales determinan el riesgo de cáncer nasofaríngeo.

Investigadores de la Escuela de Salud Pública Mailman de la Universidad de Columbia (Nueva York, NY, EE.UU.) implementaron un análisis genómico a gran escala para estudiar las interacciones genéticas entre el huésped y el virus implicadas en el cáncer. Este enfoque evaluó conjuntamente la variación genética humana y la diversidad de secuencias del VEB, en lugar de analizar cada genoma por separado. Este diseño se utilizó para identificar combinaciones de alelos del antígeno leucocitario humano (HLA) y variantes del VEB asociadas con el carcinoma nasofaríngeo.

El equipo analizó datos de asociación del genoma humano junto con la secuenciación del genoma completo del VEB mediante un marco analítico por etapas que integra la genética estadística con métodos de inferencia causal. El proceso tuvo en cuenta la estructura poblacional tanto en el genoma humano como en el viral, el parentesco entre las muestras y las pruebas múltiples. Esto permitió una búsqueda sistemática de efectos de interacción en ambos genomas que no se detectarían con análisis de un solo genoma.

Se observó una interacción clave entre el alelo HLA-A*11:01 y una variante de un solo nucleótido (85841G) en el gen EBNA3B del VEB. Los individuos con antecedentes HLA susceptibles infectados con cepas de VEB de alto riesgo portadoras de la variante 85841G mostraron un riesgo considerablemente elevado de carcinoma nasofaríngeo.

Los experimentos funcionales demostraron que la mutación viral genera un péptido presentado por HLA-A*11:01, lo que desencadena respuestas de células T CD8+ restringidas por HLA-A*11:01 que eliminan las células B transformadas por el VEB portadoras de la variante 85841G.

Los hallazgos se publicaron en Nature el 15 de abril de 2026. El material presentado destaca el creciente papel de la genómica estadística y la inferencia causal a medida que se integran múltiples sistemas genómicos para esclarecer mecanismos complejos de enfermedades. El marco del estudio subraya cómo la genética combinada huésped-patógeno puede mejorar la comprensión de la susceptibilidad al cáncer.

"La mayoría de los estudios genéticos examinan el genoma del huésped o el del patógeno por separado", afirmó Zhonghua Liu, doctor en Ciencias, profesor adjunto de Bioestadística en la Escuela Mailman de Columbia y coautor principal. "Al analizar ambos genomas conjuntamente mediante métodos avanzados de genética estadística y marcos de interacción inspirados en la inferencia causal, podemos identificar y cuantificar interacciones genéticas que de otro modo permanecerían ocultas".

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Escuela de Salud Pública Mailman de la Universidad de Columbia

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