Prueba basada en CRISPR identifica simultáneamente múltiples virus respiratorios

La cocirculación de virus respiratorios complica el diagnóstico diferencial, ya que la superposición de síntomas puede dificultar la identificación de la etiología. Las pruebas multiplex suelen depender de múltiples enzimas o fluoróforos y de flujos de trabajo complejos que sobrecargan los laboratorios clínicos.

Métodos más rápidos y sencillos que permitan detectar varios virus de ARN en una sola reacción mejorarían el rendimiento y la clasificación de los casos. Ahora, una nueva tecnología de diagnóstico permite la identificación simultánea de múltiples virus y variantes mediante la medición de la velocidad de reacción de las tijeras genéticas CRISPR.

El Instituto Avanzado de Ciencia y Tecnología de Corea (KAIST), en colaboración con la Universidad de California, Berkeley, y los Institutos Gladstone, ha desarrollado un método de diagnóstico de ARN denominado codificación cinética. Este sistema utiliza la proteína Cas13, basada en CRISPR, que se activa al reconocer el objetivo y luego corta el ARN circundante para generar una señal fluorescente. Al diferenciar los objetivos según la velocidad de corte, este método elimina la necesidad de múltiples nucleasas, que suelen requerir las tecnologías CRISPR existentes.

A nivel de molécula única dentro de microgotas, surgen patrones distintivos de velocidad de reacción para cada combinación de ARN guía y ARN diana, lo que permite una clasificación similar a códigos de barras. El ARN guía es una molécula de ARN que dirige el sistema de edición genética hacia una diana específica al proporcionar la información posicional necesaria.

Los investigadores ajustaron estas cinéticas mediante modificaciones en el diseño del ARN guía, permitiendo una detección simultánea y escalable de una amplia variedad de virus. Debido a que Cas13 analiza directamente el ARN, el flujo de trabajo omite la transcripción inversa, reduciendo pasos en comparación con los enfoques convencionales.

En pruebas realizadas con muestras clínicas reales, el método permitió distinguir múltiples virus respiratorios y variantes del SARS-CoV-2 en una sola reacción. Los investigadores señalan que el uso de un único tipo de nucleasa para detectar múltiples infecciones reduce la complejidad del sistema, manteniendo la capacidad de detección múltiple. El estudio se publicó el 31 de marzo de 2026 en Nature Biomedical Engineering.

“Este estudio va más allá de simplemente determinar si hay un virus presente, y es el primer caso en utilizar la velocidad de reacción de las tijeras genéticas como una nueva forma de información diagnóstica. Se convertirá en una plataforma de última generación capaz de diagnosticar diversas enfermedades infecciosas simultáneamente sobre el terreno”, afirmó el profesor Sungmin Son, del Departamento de Bioingeniería y Neuroingeniería de KAIST.

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