Evalúan pruebas clínicas de la línea germinal para los pacientes con cáncer pediátrico

El cáncer pediátrico es raro, con menos de 10.000 tumores sólidos diagnosticados anualmente en niños en los EUA. Estudios previos que cuestionaban la predisposición de la línea germinal en general entre los tipos de cáncer pediátrico, han encontrado una predisposición de la línea germinal hereditaria en el 8% -12% de los pacientes.

El rendimiento de la predisposición de la línea germinal detectada depende de los genes incluidos para el análisis y la interpretación de las variantes, así como de los sesgos de verificación encontrados en cada cohorte. Se requieren datos iterativos para ampliar la comprensión de la susceptibilidad al cáncer pediátrico y determinar hasta qué punto los datos de la línea germinal pueden traducirse en la práctica clínica.

Los pediatras y sus colegas del Centro Oncológico Memorial Sloan Kettering (Nueva York, NY, EUA), llevaron a cabo una secuenciación de ADN de tumor normal coincidente en 751 pacientes pediátricos con cáncer tratados en el centro desde julio de 2015 hasta julio de 2020. Las muestras de tumor y sangre se obtuvieron y secuenciaron con la plataforma MSK-IMPACT, un ensayo NGS, basado en captura, capaz de identificar mutaciones de secuencia, alteraciones en el número de copias y fusiones de genes selectos en 468 genes. Los datos de la línea germinal se analizaron en 88 genes y se informaron variantes patógenas y probablemente patógenas (P/LP) de la línea germinal. El estudio cubrió varios tipos diferentes de cáncer, incluidos sarcoma, neuroblastoma, tumores del sistema nervioso central (SNC), retinoblastoma y otros tumores sólidos poco comunes.

El equipo informó que se encontraron una o más variantes de P/LP en 138/751 (18%) de los individuos al incluir variantes en genes dominantes o recesivos de baja, moderada y alta penetrancia o en 99/751 (13%) de individuos en genes dominantes de penetrancia moderada y alta. El 34% de las variantes de penetrancia alta o moderada encontradas fueron inesperadas según el diagnóstico del paciente y los antecedentes y el 76% de los pacientes con resultados positivos completaron una consulta de genética clínica y el 21% tuvo al menos un familiar a quien le realizaron pruebas en cascada como resultado de esta prueba.

Se encontraron variantes de la línea germinal en el 49% de los pacientes con retinoblastoma, el 21% de los pacientes con tumores del SNC, el 15% de los pacientes con neuroblastoma, el 12% de los pacientes con sarcoma y el 19% de los pacientes con otros tipos de tumores. Las mutaciones más comunes en genes de penetrancia alta o moderada fueron en RB1 (encontrada en el 4% de los pacientes), NF1 (1%) y TP53 (1%) en pacientes con retinoblastoma y aquellos con diagnóstico clínico previo de neurofibromatosis tipo 1 (NF1) - o tumores asociados al síndrome de Li Fraumeni (LFS).

Aproximadamente el 3% de los pacientes tenían variantes en los genes de reparación de daños en el ADN, el 1,6% tenía mutaciones en la vía RAS-MEK o mTOR-PTEN y el 1% tenía variantes en las vías metabólicas relacionadas con el cáncer. Entre las enfermedades genéticas que no fueron identificadas por MSK-IMPACT, en este estudio, se encontraba el trastorno del crecimiento, síndrome de Beckwith-Wiedemann, identificado en cuatro pacientes. Los autores sugirieron combinar múltiples pruebas en tales casos, como la secuenciación de próxima generación (NGS) y la secuenciación de ARN, para detectar todo tipo de variantes genéticas.

Los autores señalaron que existen posibles ahorros de costos a través del cribado y detección temprana del cáncer, la prevención, las pruebas genéticas previas a la implantación y terapias potencialmente más efectivas; sin embargo, también hay costos significativos asociados con cada uno de estos, además de los costos de secuenciación y consultas de genética clínica. El estudio fue publicado el 15 de febrero de 2021 en la revista Nature Cancer.

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Centro Oncológico Memorial Sloan Kettering