Nueva herramienta evalúa el costo de las pruebas de ctADN

La estimación del costo total de las pruebas de ctADN es necesaria para el reembolso y la implementación, pero es un desafío debido a las variaciones en el flujo de trabajo.

Recientes estudios de prueba de concepto han demostrado el potencial diagnóstico del análisis de fragmentos de ADN circulantes derivados de tumores como biomarcador tumoral que respalda la toma de decisiones clínicas. Estos fragmentos de ctADN se pueden analizar mediante métodos de biopsia líquida en plasma sanguíneo y orina, entre otros.

Científicos médicos de los Centros Médicos de la Universidad de Ámsterdam (Ámsterdam, Países Bajos) desarrollaron un marco que proporciona un cálculo de costo total consistente para las pruebas de ctADN en diferentes flujos de trabajo y plataformas de diagnóstico, incluidos aspectos como personal, materiales, gastos generales y fallas, teniendo en cuenta el volumen de prueba. Los desarrolladores del marco también proporcionan una herramienta de acceso abierto para permitir cálculos específicos de laboratorio para explorar los costos totales de los parámetros de flujo de trabajo específicos de las pruebas de ctADN.

El flujo de trabajo de diagnóstico para las pruebas de ctADN se mapeó en discusiones interactivas con expertos, incluidos especialistas en medicina de laboratorio, biólogos clínicos moleculares, patólogos, científicos clínicos en patología molecular, técnicos de laboratorio y especialistas en ctADN, empezando desde la recolección de muestras de sangre hasta el resultado de la prueba de diagnóstico. Se utilizó un enfoque de microcosto para el cálculo de costos a fin de garantizar que los recursos reales utilizados y los costos unitarios de esos recursos se incluyan en los cálculos de costos. El método de la herramienta de cálculo de costos se basó en el método de cálculo de costos basado en actividades. De acuerdo con el método de costos basado en actividades, los objetos de costo consumen actividades y las actividades consumen costos.

El equipo informó que los costos totales por muestra disminuyen a medida que aumenta el volumen de pruebas. Por lo tanto, los costos totales por muestra se informan para un volumen de prueba de uno hasta el volumen máximo de prueba de las plataformas. El volumen máximo de pruebas varía entre los estudios de casos. Para el caso de estudio Digital Droplet PCR, los costos oscilaron entre 199 y 1.420 dólares, con un volumen de análisis máximo (es decir, 200 muestras por semana para este caso de estudio) a una muestra por semana. Para el estudio de caso Real-Time PCR 1, los costos totales por muestra oscilaron entre 761 y 1.873 dólares (para 150 muestras a una muestra por semana). Para el estudio de caso Real-Time PCR 2, los costos oscilaron entre 564 y 1.148 dólares (para 20 muestras a una muestra por semana). Para el estudio de caso Espectrometría de masas, los costos oscilaron entre 481 y 2.630 dólares (para 28 muestras a una muestra por semana). Para el estudio de caso Commercial NGS Panel, los costos oscilaron entre 1.683 y 8.399) (para 32 muestras a una muestra por semana). Para el estudio de caso Custom NGS Panel, los costos oscilaron entre 592 y 9.124) (para 96 muestras a una muestra por semana).

Los autores concluyeron que han desarrollado un marco adaptable de microcostos y una herramienta de acceso abierto que les permite a los usuarios explorar los costos totales del análisis de ctADN por muestra, desde la recolección de muestras hasta el resultado de la prueba de diagnóstico, de diferentes flujos de trabajo de diagnóstico. El estudio fue publicado el 16 de noviembre de 2022 en el Journal of Molecular Diagnostics.

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Centros Médicos de la Universidad de Amsterdam