Utilizamos cookies para comprender de qué manera utiliza nuestro sitio y para mejorar su experiencia. Esto incluye personalizar el contenido y la publicidad. Para más información, Haga clic. Si continua usando nuestro sitio, consideraremos que acepta que utilicemos cookies. Política de cookies.

Please note that the LabMedica website is also available in a complete English version
Presenta Sitios para socios Información LinkXpress
Ingresar
Publique su anuncio con nosotros
PURITAN MEDICAL

Deascargar La Aplicación Móvil




Eventos

01 mar 2020 - 05 mar 2020
05 mar 2020 - 07 mar 2020
11 mar 2020 - 13 mar 2020

Secuenciación con nanoporos diagnostica la enfermedad intestinal rápidamente en los bebés pretérmino

Por el equipo editorial de LabMedica en español
Actualizado el 08 Jan 2020
Print article
Imagen: El flongle es un adaptador (dongle de celda de flujo) para MinION o GridION que permite la secuenciación directa de ADN o ARN en tiempo real en celdas de flujo más pequeñas y de un solo uso (Fotografía cortesía de Oxford Nanopore Technologies).
Imagen: El flongle es un adaptador (dongle de celda de flujo) para MinION o GridION que permite la secuenciación directa de ADN o ARN en tiempo real en celdas de flujo más pequeñas y de un solo uso (Fotografía cortesía de Oxford Nanopore Technologies).
La secuenciación metagenómica, sin necesidad de cultivo, sensible y rica en datos, combinada con herramientas bioinformáticas potentes, han permitido a los científicos diferenciar grupos de pacientes de individuos sanos en función de sus perfiles microbianos.

La metagenómica también permite la identificación de rasgos funcionales, por ejemplo, genes de resistencia a antibióticos, que son importantes a la luz de la amenaza de resistencia a los antimicrobianos (AMR). La optimización de las metodologías metagenómicas y las herramientas de bioinformática podrían permitir la identificación de individuos en riesgo, la elaboración de perfiles de agentes infecciosos y la personalización de los tratamientos.

Los científicos del Instituto Earlham (Norwich, Reino Unido) y sus asociados, utilizaron la plataforma MinION (Oxford Nanopore Technologies, Oxford Science Park, Reino Unido), junto con el paquete de software NanoOK RT del Instituto para realizar secuencias metagenómicas de escopeta y analizar comunidades simuladas y muestras fecales de bebés prematuros sanos y enfermos. Se usó la secuenciación metagenómica de nanoporos para diagnosticar rápidamente a los recién nacidos prematuros con sospecha de enterocolitis necrotizante (ECN), una afección intestinal potencialmente mortal, identificando patógenos y genes de resistencia antimicrobiana en el microbioma intestinal en cuestión de unas pocas horas.

Los datos de Nanopore clasificaron de manera confiable una comunidad simulada de 20 especies y capturaron la diversidad de la microbiota intestinal inmadura con el tiempo y en respuesta a intervenciones como la suplementación con probióticos, el tratamiento con antibióticos o episodios de sospecha de sepsis. El equipo también realizó procesamientos rápidos en tiempo real para evaluar las comunidades microbianas asociadas al intestino en lactantes críticos y sanos, facilitado por el paquete de software NanoOK RT, que analizaba las secuencias a medida que se generaban. Los científicos compararon sus resultados con la secuenciación realizada por Illumina (Illumina, San Diego, CA, EUA).

La cartera del equipo identificó de manera confiable las bacterias patógenas (es decir, Klebsiella pneumoniae y Enterobacter cloacae) y sus correspondientes perfiles de genes de resistencia a los antimicrobianos en tan solo una hora después de la secuenciación. Los resultados se confirmaron utilizando aislamiento de patógenos, secuenciación de genoma completo y pruebas de susceptibilidad a antibióticos, así como comunidades simuladas y muestras clínicas con genes de resistencia a antimicrobianos conocidos.

Lindsay J. Hall, PhD, microbióloga y autora principal del estudio, dijo: “Las mejoras a través de la secuenciación de nanoporos son la naturaleza rápida y la especificidad de la prueba. Esto es muy útil con bebés muy enfermos que necesitan ser tratados lo más rápido posible, además de proporcionar información clave para que el médico los trate con antibióticos que puedan matar la bacteria. Las pruebas actuales tardan mucho más y podrían no detectar todos los tipos de resistencia a los antibióticos”.

Los autores concluyeron que sus resultados demuestran que MinION (incluidas las células de flujo rentables Flongle) con NanoOK RT, puede procesar muestras metagenómicas en un conjunto rico de datos en un tiempo inferior a cinco horas, lo que crea una plataforma para futuros estudios destinados a desarrollar estas herramientas y métodos en entornos clínicos con un enfoque en proporcionar opciones de tratamiento antimicrobianos a la medida para los pacientes. El estudio fue publicado el 16 de diciembre de 2019 en la revista Nature Microbiology.

Enlace relacionado:
Instituto Earlham
Oxford Nanopore Technologies
Illumina


Print article

Canales

Química Clínica

ver canal
Imagen: El sistema de detección de biomarcadores ultrasensibles Quanterix SR-X utiliza tecnología de array molecular único (SIMOA) (Fotografía cortesía de Quanterix Corporation).

Asocian biomarcadores sanguíneos con la conmoción cerebral aguda relacionada con los deportes

Durante la última década, han surgido varios biomarcadores candidatos como posibles marcadores diagnósticos de las lesiones cerebrales traumáticas (LCT) y se estima que el 90% de las lesiones cerebrales... Más

Diagnóstico Molecular

ver canal
Imagen: Microfotografía electrónica del coronavirus que toma su nombre de su halo en forma de corona (Fotografía cortesía de EYE OF SCIENCE/SPL).

Crisis de salud por el coronavirus: la carrera por soluciones diagnósticas

Un nuevo coronavirus designado COVID-19, también conocido como 2019-nCoV se extiende rápidamente, desde su origen en Wuhan, provincia de Hubei, China. En la actualidad, el número de infectados en todo... Más

Hematología

ver canal
Imagen: El kit VisuLize Factor XI ELISA es un inmunoensayo enzimático para la determinación cuantitativa del factor XI en muestras de plasma humano utilizando el ensayo de inmunoabsorción de doble anticuerpo ligado a enzimas (ELISA) (Fotografía cortesía de Affinity Biologicals, Inc).

Examinan la incidencia del inhibidor contra el factor IX en la hemofilia B pediátrica

La hemofilia B es un trastorno de la coagulación de la sangre que causa hematomas y hemorragias fáciles debido a una mutación hereditaria del gen para el factor IX, y que resulta en una deficiencia del factor IX.... Más

Patología

ver canal
Imagen: Esta comparación lado a lado de una biopsia de tejido mamario demuestra algunas de las capacidades del microscopio híbrido óptico-infrarrojo. A la izquierda, una muestra de tejido teñida por métodos tradicionales. Centro, una coloración computarizada creada a partir de imágenes híbridas óptico-infrarrojas. Derecha, tipos de tejidos identificados con datos infrarrojos. El rosa en esta imagen significa cáncer maligno (Fotografía cortesía de Rohit Bhargava, PhD).

Realizan una histopatología completamente digital mediante un microscopio híbrido óptico-infrarrojo

El estándar de oro de la patología de los tejidos es agregar colorantes o tinciones para que los patólogos puedan ver las formas y patrones de las células mediante un microscopio. Sin embargo, en ocasiones,... Más

Tecnología de Lab

ver canal
Imagen: Esquema de una serie de nanotubos decorados con nanopartículas de oro que capturan moléculas virales para la espectroscopía Raman in situ con el fin de realizar identificación óptica de virus sin necesidad de etiquetas (Fotografía cortesía del profesor Mauricio Terrones)

Dispositivo rápido y económico captura e identifica virus

Actualmente, los virólogos estiman que en los animales se encuentran 1,67 millones de virus desconocidos, algunos de los cuales pueden ser transmitidos a los humanos. Los virus conocidos, como el H5N1,... Más

Industria

ver canal
Imagen: En 2019, se espera que los diagnósticos de laboratorio en un chip/microfluídicos crezcan al ritmo más rápido de TCAC, debido a su capacidad para reducir los procesos de laboratorio completos a un solo chip y acelerar el proceso de diagnóstico de enfermedades con resultados cuantitativos de alta precisión (Fotografía cortesía de Fotolia).

Mercado mundial de inmunoanálisis microfluidos llegará a los dos mil millones de dólares en 2025

Se espera que el mercado global de inmunoanálisis microfluídico crezca a una tasa anual compuesta del 12,7% desde 2019, a dos mil millones de dólares para 2025, impulsado por los mayores beneficios ofrecidos... Más
Copyright © 2000-2020 Globetech Media. All rights reserved.