Identifican firma de metilación para las metástasis cerebrales del cáncer de pulmón

Alrededor del 20% al 40% de los adultos con cáncer de pulmón no microcítico desarrollan metástasis cerebrales en algún momento durante su enfermedad.

La metilación del ADN es un proceso mediante el cual se agregan grupos metilo a la molécula de ADN. La metilación puede cambiar la actividad de un segmento de ADN sin cambiar su secuencia. Cuando se encuentra en un gen promotor, la metilación del ADN generalmente actúa con el fin de reprimir la transcripción de los genes.

Los científicos del Hospital de Cáncer de Zhejiang (Hangzhou, China), realizaron una secuenciación dirigida, basada en captura, para buscar mutaciones somáticas en 60 pacientes con cáncer de pulmón no microcítico avanzado (CPNM), sin tratamiento previo, utilizando un panel de 520 genes relacionados con el cáncer, así como un análisis de metilación de ADN utilizando un panel de metilación que constaba de 100.000 sitios CpG. Los pacientes se dividieron en tres grupos: uno con metástasis cerebrales, un segundo con metástasis leptomeníngeas y el tercero sin metástasis.

El equipo identificó 370 mutaciones en las lesiones primarias del pulmón y 574 mutaciones en las metástasis cerebrales. Entre ellos, se compartían 242 mutaciones; de ellas, 128 fueron específicas de pulmón primario y 332 fueron específicas de cerebro. Entre las mutaciones específicas de las metástasis cerebrales, el 82% de ellas fueron variaciones en el número de copias (VNC), que fue significativamente mayor que las VNC encontradas en los tumores primarios. Solo el 16% de las VNC se encontraron tanto en los pulmones como en el cerebro. Los investigadores también realizaron un análisis de vías de los genes que solo estaban mutados en el cerebro y encontraron un enriquecimiento de genes en las vías de adhesión focal y en PI3K-AKT.

En el grupo de metástasis leptomeníngeas, el equipo encontró una concordancia significativa entre las mutaciones impulsoras en el tejido pulmonar primario y las metástasis en el líquido cefalorraquídeo. Sin embargo, estas metástasis no tenían un número significativamente mayor de VNC que los tumores primarios. También encontraron que la lista de genes mutados era comparable en las tres cohortes de pacientes; luego recurrieron al análisis de metilación del ADN para ver si podían encontrar marcadores que indicaran una mayor probabilidad de desarrollar metástasis.

El análisis de metilación reveló patrones definidos, con 268 bloques de metilación que se metilaron de manera diferencial significativamente entre las lesiones pulmonares primarias y las metástasis cerebrales. Entre ellos, 211 bloques estaban hipermetilados en el cerebro y los 57 bloques restantes estaban hipermetilados en las lesiones pulmonares. Cuando compararon las metástasis leptomeníngeas con los pacientes no metastásicos, encontraron 323 bloques que estaban metilados de manera diferencial. De estos, el cerebro y los grupos de metástasis leptomeníngeas compartieron 15 bloques de metilación que los científicos creen que pueden pronosticar la metástasis al sistema nervioso central. A través de un análisis de regresión gradual, el equipo pudo reducir la firma aún más a seis bloques de metilación. El estudio fue presentado en el congreso anual de la Sociedad Europea de Oncología Médica celebrado del 27 de septiembre al 1 de octubre de 2019 en Barcelona, España.

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Hospital de Cáncer de Zhejiang