Bacterias en vejiga femenina revelan microbiota urogenital

Al contrario del dogma médico, la orina no es estéril, incluso en individuos asintomáticos. Durante más de 60 años, el protocolo estándar de cultivo de orina ha representado la principal herramienta para detectar las bacterias en los laboratorios de microbiología clínica.

El análisis independiente del cultivo de la orina obtenida por aspiración suprapúbica, que pasa por alto la vulva, la vagina y la uretra, demuestra la presencia de bacterias en la vejiga de las mujeres. Un nuevo estudio ha encontrado que la vejiga femenina no solo contiene bacterias, sino que los microbios son similares a los que se encuentran en la vagina.

Científicos de la Universidad de Loyola en Chicago (Maywood, IL, EUA) y sus colegas internacionales recolectaron muestras de orina mediante catéter transuretral de mujeres que fueron reclutadas de un estudio separado. Cuatro pacientes fueron elegidas para que les tomaran muestras tanto de la vejiga como de los entornos vaginales. Todas las muestras de orina fueron cultivadas mediante métodos estándar (MCS), así como un cultivo de orina cuantitativo expandido (EQUC). Cada tipo de colonia morfológicamente diferente se aisló en una placa diferente del mismo medio para preparar un cultivo puro que se usó para la identificación. Se usó la espectrofotometría de masas con tiempo de vuelo y ionización por desorción láser asistida por matriz con el programa de software MALDI Biotyper 3.0 (Bruker Daltonics, Billerica, MA, EUA) para identificar las cepas bacterianas.

El ADN genómico se extrajo de células compactadas usando un método de fenol-cloroformo. El ADN se preparó y secuenció utilizando la plataforma Illumina Hi-Seq (Illumina, San Diego, CA, EUA) con tamaños de fragmentos de biblioteca de 200-300 pb y una longitud de lectura de 100 pb. La secuenciación metagenómica del genoma completo se realizó en el Illumina HiSeq 2500. El análisis filogenético se realizó extrayendo la secuencia de aminoácidos de 40 genes marcadores universales de una sola copia de colecciones bacterianas.

El equipo aisló y secuenció el genoma de 149 cepas bacterianas de orina cateterizada de 77 mujeres. Esta colección de cultivos abarca 78 especies, que representan aproximadamente dos tercios de la diversidad bacteriana dentro de las vejigas muestreadas, incluyendo Proteobacteria, Actinobacteria y Firmicutes. La comparación genómica y funcional detallada de la microbiota vesical con las microbiotas gastrointestinales y vaginales demuestra una microbiota vaginal y vesical similar, con capacidades funcionales distintas de las observadas en la microbiota gastrointestinal. Las especies Uropatogénicas, tales como Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, Enterobacter cloaceae, Morganella morganii y Pseudomonas aeruginosa, representaron solo el 7,7% (6/78) de la diversidad filogenética cultivable de la vejiga.

El análisis filogenético del genoma completo de las cepas bacterianas aisladas de la vagina y la vejiga en las mismas mujeres identificó cepas muy similares de E. coli, Streptococcus anginosus, Lactobacillus iners y Lactobacillus crispatus, lo que sugiere una microbiota urogenital femenina interconectada que no solo se limita a los patógenos sino que también es característico de los comensales asociados a la salud.

El autor concluyó que esta colección única de cultivos a los que se les secuenció el genoma debería alterar la forma en que los doctores ven las bacterias del piso pélvico femenino proporcionando nuevas opciones de diagnóstico y tratamiento para las infecciones del tracto urinario (ITU), la incontinencia urinaria de urgencia y otros trastornos asociados del tracto urinario. El estudio fue publicado originalmente en línea el 19 de abril de 2018, en la revista Nature Communications.